Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim3Q99PE5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim3Q99PE5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim3Q99PE5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim3Q99PE5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smim3Q99PE5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Smim3Q99PE5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smim3Q99PE5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim3Q99PE5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim3Q99PE5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim3Q99PE5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim3Q99PE5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim3Q99PE5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim3Q99PE5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim3Q99PE5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim3Q99PE5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim3Q99PE5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim3Q99PE5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim3Q99PE5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim3Q99PE5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim3Q99PE5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim3Q99PE5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smim3Q99PE5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim3Q99PE5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smim3Q99PE5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim3Q99PE5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim3Q99PE5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim3Q99PE5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim3Q99PE5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim3Q99PE5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim3Q99PE5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smim3Q99PE5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smim3Q99PE5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim3Q99PE5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim3Q99PE5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim3Q99PE5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim3Q99PE5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim3Q99PE5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim3Q99PE5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim3Q99PE5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim3Q99PE5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim3Q99PE5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim3Q99PE5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim3Q99PE5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim3Q99PE5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim3Q99PE5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smim3Q99PE5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim3Q99PE5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim3Q99PE5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim3Q99PE5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim3Q99PE5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim3Q99PE5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim3Q99PE5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim3Q99PE5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim3Q99PE5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smim3Q99PE5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim3Q99PE5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim3Q99PE5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim3Q99PE5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim3Q99PE5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim3Q99PE5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim3Q99PE5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smim3Q99PE5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim3Q99PE5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim3Q99PE5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim3Q99PE5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim3Q99PE5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim3Q99PE5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim3Q99PE5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim3Q99PE5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim3Q99PE5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim3Q99PE5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim3Q99PE5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms