Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
4930550L24RikQ99PA7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930550L24RikQ99PA7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930550L24RikQ99PA7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
4930550L24RikQ99PA7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930550L24RikQ99PA7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930550L24RikQ99PA7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930550L24RikQ99PA7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930550L24RikQ99PA7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms