Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,17■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,14■□□□□ 0,98
Ms4a6dQ99N07 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,09■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ms4a6dQ99N07 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Ms4a6dQ99N07 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Ms4a6dQ99N07 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ms4a6dQ99N07 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ms4a6dQ99N07 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ms4a6dQ99N07 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ms4a6dQ99N07 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ms4a6dQ99N07 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ms4a6dQ99N07 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,95■□□□□ 0,94
Ms4a6dQ99N07 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ms4a6dQ99N07 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ms4a6dQ99N07 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Ms4a6dQ99N07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Ms4a6dQ99N07 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,94
Ms4a6dQ99N07 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ms4a6dQ99N07 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ms4a6dQ99N07 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ms4a6dQ99N07 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ms4a6dQ99N07 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Ms4a6dQ99N07 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Ms4a6dQ99N07 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ms4a6dQ99N07 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ms4a6dQ99N07 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20,84■□□□□ 0,93
Ms4a6dQ99N07 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ms4a6dQ99N07 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20,81■□□□□ 0,92
Ms4a6dQ99N07 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ms4a6dQ99N07 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ms4a6dQ99N07 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ms4a6dQ99N07 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,77■□□□□ 0,92
Ms4a6dQ99N07 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Ms4a6dQ99N07 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Ms4a6dQ99N07 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Ms4a6dQ99N07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,75■□□□□ 0,91
Ms4a6dQ99N07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Ms4a6dQ99N07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ms4a6dQ99N07 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ms4a6dQ99N07 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ms4a6dQ99N07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Ms4a6dQ99N07 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Ms4a6dQ99N07 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Ms4a6dQ99N07 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ms4a6dQ99N07 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ms4a6dQ99N07 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ms4a6dQ99N07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Ms4a6dQ99N07 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ms4a6dQ99N07 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ms4a6dQ99N07 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Ms4a6dQ99N07 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Ms4a6dQ99N07 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Ms4a6dQ99N07 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ms4a6dQ99N07 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ms4a6dQ99N07 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ms4a6dQ99N07 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ms4a6dQ99N07 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,3 ms