Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG5

Lsr, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsrQ99KG5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
LsrQ99KG5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
LsrQ99KG5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,68
LsrQ99KG5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
LsrQ99KG5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
LsrQ99KG5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,48■■□□□ 1,67
LsrQ99KG5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
LsrQ99KG5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
LsrQ99KG5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
LsrQ99KG5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
LsrQ99KG5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
LsrQ99KG5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
LsrQ99KG5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
LsrQ99KG5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
LsrQ99KG5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,39■■□□□ 1,66
LsrQ99KG5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
LsrQ99KG5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
LsrQ99KG5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
LsrQ99KG5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
LsrQ99KG5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
LsrQ99KG5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
LsrQ99KG5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
LsrQ99KG5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
LsrQ99KG5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
LsrQ99KG5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
LsrQ99KG5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
LsrQ99KG5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
LsrQ99KG5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
LsrQ99KG5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,23■■□□□ 1,63
LsrQ99KG5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
LsrQ99KG5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
LsrQ99KG5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
LsrQ99KG5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
LsrQ99KG5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,18■■□□□ 1,62
LsrQ99KG5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,18■■□□□ 1,62
LsrQ99KG5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,18■■□□□ 1,62
LsrQ99KG5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
LsrQ99KG5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
LsrQ99KG5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
LsrQ99KG5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
LsrQ99KG5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
LsrQ99KG5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
LsrQ99KG5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
LsrQ99KG5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
LsrQ99KG5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
LsrQ99KG5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,13■■□□□ 1,61
LsrQ99KG5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,1■■□□□ 1,61
LsrQ99KG5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
LsrQ99KG5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
LsrQ99KG5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
LsrQ99KG5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
LsrQ99KG5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
LsrQ99KG5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,03■■□□□ 1,6
LsrQ99KG5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
LsrQ99KG5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24,99■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
LsrQ99KG5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
LsrQ99KG5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
LsrQ99KG5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
LsrQ99KG5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
LsrQ99KG5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
LsrQ99KG5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
LsrQ99KG5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
LsrQ99KG5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
LsrQ99KG5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
LsrQ99KG5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
LsrQ99KG5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
LsrQ99KG5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
LsrQ99KG5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
LsrQ99KG5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
LsrQ99KG5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
LsrQ99KG5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
LsrQ99KG5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
LsrQ99KG5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
LsrQ99KG5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,78■■□□□ 1,56
LsrQ99KG5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
LsrQ99KG5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
LsrQ99KG5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
LsrQ99KG5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
LsrQ99KG5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
LsrQ99KG5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
LsrQ99KG5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
LsrQ99KG5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24,71■■□□□ 1,55
LsrQ99KG5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24,7■■□□□ 1,54
LsrQ99KG5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
LsrQ99KG5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
LsrQ99KG5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
LsrQ99KG5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
LsrQ99KG5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
LsrQ99KG5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms