Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nlgn1Q99K10 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nlgn1Q99K10 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nlgn1Q99K10 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Nlgn1Q99K10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Nlgn1Q99K10 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Nlgn1Q99K10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Nlgn1Q99K10 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Nlgn1Q99K10 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Nlgn1Q99K10 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Nlgn1Q99K10 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Nlgn1Q99K10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nlgn1Q99K10 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nlgn1Q99K10 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Nlgn1Q99K10 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nlgn1Q99K10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nlgn1Q99K10 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Nlgn1Q99K10 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Nlgn1Q99K10 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Nlgn1Q99K10 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nlgn1Q99K10 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Nlgn1Q99K10 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Nlgn1Q99K10 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Nlgn1Q99K10 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Nlgn1Q99K10 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Nlgn1Q99K10 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Nlgn1Q99K10 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Nlgn1Q99K10 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Nlgn1Q99K10 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Nlgn1Q99K10 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Nlgn1Q99K10 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Nlgn1Q99K10 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Nlgn1Q99K10 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Nlgn1Q99K10 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Nlgn1Q99K10 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Nlgn1Q99K10 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Nlgn1Q99K10 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Nlgn1Q99K10 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Nlgn1Q99K10 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Nlgn1Q99K10 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Nlgn1Q99K10 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Nlgn1Q99K10 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Nlgn1Q99K10 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Nlgn1Q99K10 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Nlgn1Q99K10 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Nlgn1Q99K10 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Nlgn1Q99K10 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nlgn1Q99K10 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Nlgn1Q99K10 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Nlgn1Q99K10 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Nlgn1Q99K10 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Nlgn1Q99K10 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Nlgn1Q99K10 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Nlgn1Q99K10 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Nlgn1Q99K10 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Nlgn1Q99K10 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Nlgn1Q99K10 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Nlgn1Q99K10 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Nlgn1Q99K10 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Nlgn1Q99K10 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Nlgn1Q99K10 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Nlgn1Q99K10 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Nlgn1Q99K10 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Nlgn1Q99K10 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Nlgn1Q99K10 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Nlgn1Q99K10 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Nlgn1Q99K10 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Nlgn1Q99K10 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Nlgn1Q99K10 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Nlgn1Q99K10 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Nlgn1Q99K10 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Nlgn1Q99K10 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Nlgn1Q99K10 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Nlgn1Q99K10 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Nlgn1Q99K10 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Nlgn1Q99K10 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Nlgn1Q99K10 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nlgn1Q99K10 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nlgn1Q99K10 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nlgn1Q99K10 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Nlgn1Q99K10 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Nlgn1Q99K10 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Nlgn1Q99K10 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Nlgn1Q99K10 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Nlgn1Q99K10 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Nlgn1Q99K10 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Nlgn1Q99K10 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Nlgn1Q99K10 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Nlgn1Q99K10 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Nlgn1Q99K10 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Nlgn1Q99K10 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Nlgn1Q99K10 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Nlgn1Q99K10 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Nlgn1Q99K10 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Nlgn1Q99K10 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Nlgn1Q99K10 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Nlgn1Q99K10 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Nlgn1Q99K10 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Nlgn1Q99K10 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Nlgn1Q99K10 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms