Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC40,91■■■■■ 4,14
Alpk3Q924C5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Alpk3Q924C5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC40,91■■■■■ 4,14
Alpk3Q924C5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Alpk3Q924C5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Alpk3Q924C5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Alpk3Q924C5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,12
Alpk3Q924C5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,81■■■■■ 4,12
Alpk3Q924C5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC40,75■■■■■ 4,11
Alpk3Q924C5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC40,73■■■■■ 4,11
Alpk3Q924C5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Alpk3Q924C5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC40,7■■■■■ 4,11
Alpk3Q924C5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
Alpk3Q924C5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC40,62■■■■■ 4,09
Alpk3Q924C5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Alpk3Q924C5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC40,55■■■■■ 4,08
Alpk3Q924C5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
Alpk3Q924C5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC40,52■■■■■ 4,08
Alpk3Q924C5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Alpk3Q924C5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC40,5■■■■■ 4,07
Alpk3Q924C5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
Alpk3Q924C5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Alpk3Q924C5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Alpk3Q924C5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Alpk3Q924C5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Alpk3Q924C5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Alpk3Q924C5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC40,37■■■■■ 4,05
Alpk3Q924C5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Alpk3Q924C5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC40,26■■■■■ 4,04
Alpk3Q924C5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,26■■■■■ 4,03
Alpk3Q924C5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC40,24■■■■■ 4,03
Alpk3Q924C5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC40,23■■■■■ 4,03
Alpk3Q924C5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Alpk3Q924C5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Alpk3Q924C5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40,15■■■■■ 4,02
Alpk3Q924C5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC40,14■■■■■ 4,02
Alpk3Q924C5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC40,11■■■■■ 4,01
Alpk3Q924C5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Alpk3Q924C5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,08■■■■■ 4,01
Alpk3Q924C5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC40,03■■■■■ 4
Alpk3Q924C5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC40■■■■□ 3,99
Alpk3Q924C5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Alpk3Q924C5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC39,98■■■■□ 3,99
Alpk3Q924C5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC39,98■■■■□ 3,99
Alpk3Q924C5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
Alpk3Q924C5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
Alpk3Q924C5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39,94■■■■□ 3,98
Alpk3Q924C5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
Alpk3Q924C5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39,91■■■■□ 3,98
Alpk3Q924C5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
Alpk3Q924C5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Alpk3Q924C5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Alpk3Q924C5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
Alpk3Q924C5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
Alpk3Q924C5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39,81■■■■□ 3,96
Alpk3Q924C5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,8■■■■□ 3,96
Alpk3Q924C5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39,73■■■■□ 3,95
Alpk3Q924C5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC39,7■■■■□ 3,95
Alpk3Q924C5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,69■■■■□ 3,94
Alpk3Q924C5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
Alpk3Q924C5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC39,66■■■■□ 3,94
Alpk3Q924C5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC39,66■■■■□ 3,94
Alpk3Q924C5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Alpk3Q924C5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC39,6■■■■□ 3,93
Alpk3Q924C5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC39,59■■■■□ 3,93
Alpk3Q924C5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,92
Alpk3Q924C5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Alpk3Q924C5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Alpk3Q924C5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Alpk3Q924C5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,48■■■■□ 3,91
Alpk3Q924C5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Alpk3Q924C5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC39,47■■■■□ 3,91
Alpk3Q924C5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Alpk3Q924C5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Alpk3Q924C5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39,46■■■■□ 3,91
Alpk3Q924C5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC39,44■■■■□ 3,9
Alpk3Q924C5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Alpk3Q924C5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,4■■■■□ 3,9
Alpk3Q924C5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC39,39■■■■□ 3,9
Alpk3Q924C5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC39,37■■■■□ 3,89
Alpk3Q924C5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,35■■■■□ 3,89
Alpk3Q924C5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,34■■■■□ 3,89
Alpk3Q924C5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Alpk3Q924C5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC39,29■■■■□ 3,88
Alpk3Q924C5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC39,27■■■■□ 3,88
Alpk3Q924C5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39,27■■■■□ 3,88
Alpk3Q924C5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,25■■■■□ 3,87
Alpk3Q924C5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Alpk3Q924C5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,23■■■■□ 3,87
Alpk3Q924C5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Alpk3Q924C5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39,23■■■■□ 3,87
Alpk3Q924C5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Alpk3Q924C5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Alpk3Q924C5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC39,19■■■■□ 3,86
Alpk3Q924C5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Alpk3Q924C5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Alpk3Q924C5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Alpk3Q924C5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC39,18■■■■□ 3,86
Alpk3Q924C5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Alpk3Q924C5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC39,15■■■■□ 3,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms