Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Smc1bQ920F6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Smc1bQ920F6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Smc1bQ920F6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Smc1bQ920F6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Smc1bQ920F6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Smc1bQ920F6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Smc1bQ920F6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Smc1bQ920F6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Smc1bQ920F6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Smc1bQ920F6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Smc1bQ920F6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Smc1bQ920F6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Smc1bQ920F6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Smc1bQ920F6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Smc1bQ920F6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Smc1bQ920F6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Smc1bQ920F6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Smc1bQ920F6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Smc1bQ920F6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Smc1bQ920F6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Smc1bQ920F6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Smc1bQ920F6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Smc1bQ920F6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Smc1bQ920F6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Smc1bQ920F6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Smc1bQ920F6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Smc1bQ920F6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Smc1bQ920F6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Smc1bQ920F6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Smc1bQ920F6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Smc1bQ920F6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Smc1bQ920F6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Smc1bQ920F6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Smc1bQ920F6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Smc1bQ920F6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Smc1bQ920F6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Smc1bQ920F6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Smc1bQ920F6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Smc1bQ920F6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Smc1bQ920F6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Smc1bQ920F6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Smc1bQ920F6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Smc1bQ920F6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Smc1bQ920F6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Smc1bQ920F6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Smc1bQ920F6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Smc1bQ920F6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Smc1bQ920F6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Smc1bQ920F6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Smc1bQ920F6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Smc1bQ920F6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Smc1bQ920F6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Smc1bQ920F6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Smc1bQ920F6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Smc1bQ920F6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Smc1bQ920F6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Smc1bQ920F6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Smc1bQ920F6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Smc1bQ920F6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Smc1bQ920F6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Smc1bQ920F6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Smc1bQ920F6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Smc1bQ920F6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Smc1bQ920F6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Smc1bQ920F6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Smc1bQ920F6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Smc1bQ920F6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Smc1bQ920F6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Smc1bQ920F6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Smc1bQ920F6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Smc1bQ920F6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Smc1bQ920F6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Smc1bQ920F6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Smc1bQ920F6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Smc1bQ920F6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Smc1bQ920F6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Smc1bQ920F6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Smc1bQ920F6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Smc1bQ920F6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Smc1bQ920F6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Smc1bQ920F6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Smc1bQ920F6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Smc1bQ920F6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Smc1bQ920F6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Smc1bQ920F6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Smc1bQ920F6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Smc1bQ920F6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Smc1bQ920F6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Smc1bQ920F6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Smc1bQ920F6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Smc1bQ920F6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Smc1bQ920F6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Smc1bQ920F6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Smc1bQ920F6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Smc1bQ920F6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Smc1bQ920F6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Smc1bQ920F6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Smc1bQ920F6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Smc1bQ920F6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,9 ms