Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg13Q91YI1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atg13Q91YI1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atg13Q91YI1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atg13Q91YI1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg13Q91YI1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg13Q91YI1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atg13Q91YI1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atg13Q91YI1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atg13Q91YI1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atg13Q91YI1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atg13Q91YI1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atg13Q91YI1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atg13Q91YI1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg13Q91YI1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg13Q91YI1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg13Q91YI1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg13Q91YI1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atg13Q91YI1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atg13Q91YI1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atg13Q91YI1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Atg13Q91YI1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atg13Q91YI1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atg13Q91YI1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atg13Q91YI1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atg13Q91YI1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg13Q91YI1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Atg13Q91YI1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atg13Q91YI1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atg13Q91YI1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atg13Q91YI1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atg13Q91YI1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atg13Q91YI1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atg13Q91YI1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atg13Q91YI1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atg13Q91YI1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atg13Q91YI1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atg13Q91YI1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atg13Q91YI1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atg13Q91YI1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atg13Q91YI1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg13Q91YI1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atg13Q91YI1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atg13Q91YI1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atg13Q91YI1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atg13Q91YI1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atg13Q91YI1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg13Q91YI1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg13Q91YI1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg13Q91YI1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atg13Q91YI1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atg13Q91YI1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atg13Q91YI1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Atg13Q91YI1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atg13Q91YI1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atg13Q91YI1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atg13Q91YI1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg13Q91YI1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg13Q91YI1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg13Q91YI1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg13Q91YI1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg13Q91YI1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg13Q91YI1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg13Q91YI1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg13Q91YI1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg13Q91YI1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg13Q91YI1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg13Q91YI1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg13Q91YI1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg13Q91YI1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg13Q91YI1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atg13Q91YI1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg13Q91YI1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg13Q91YI1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg13Q91YI1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg13Q91YI1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg13Q91YI1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg13Q91YI1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg13Q91YI1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg13Q91YI1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg13Q91YI1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Atg13Q91YI1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atg13Q91YI1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atg13Q91YI1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atg13Q91YI1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atg13Q91YI1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg13Q91YI1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg13Q91YI1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg13Q91YI1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atg13Q91YI1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Atg13Q91YI1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg13Q91YI1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atg13Q91YI1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atg13Q91YI1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atg13Q91YI1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atg13Q91YI1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atg13Q91YI1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg13Q91YI1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atg13Q91YI1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg13Q91YI1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms