Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Sec16bQ91XT4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Sec16bQ91XT4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Sec16bQ91XT4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Sec16bQ91XT4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Sec16bQ91XT4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Sec16bQ91XT4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Sec16bQ91XT4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Sec16bQ91XT4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Sec16bQ91XT4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Sec16bQ91XT4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Sec16bQ91XT4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Sec16bQ91XT4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Sec16bQ91XT4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Sec16bQ91XT4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Sec16bQ91XT4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Sec16bQ91XT4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,56■■□□□ 1,52
Sec16bQ91XT4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Sec16bQ91XT4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,56■■□□□ 1,52
Sec16bQ91XT4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Sec16bQ91XT4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Sec16bQ91XT4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Sec16bQ91XT4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Sec16bQ91XT4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Sec16bQ91XT4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Sec16bQ91XT4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Sec16bQ91XT4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Sec16bQ91XT4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Sec16bQ91XT4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Sec16bQ91XT4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Sec16bQ91XT4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Sec16bQ91XT4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Sec16bQ91XT4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Sec16bQ91XT4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,33■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,33■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Sec16bQ91XT4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,27■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Sec16bQ91XT4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Sec16bQ91XT4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Sec16bQ91XT4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Sec16bQ91XT4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Sec16bQ91XT4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
Sec16bQ91XT4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Sec16bQ91XT4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Sec16bQ91XT4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Sec16bQ91XT4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
Sec16bQ91XT4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Sec16bQ91XT4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
Sec16bQ91XT4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Sec16bQ91XT4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Sec16bQ91XT4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Sec16bQ91XT4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Sec16bQ91XT4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24,14■■□□□ 1,46
Sec16bQ91XT4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Sec16bQ91XT4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sec16bQ91XT4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Sec16bQ91XT4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Sec16bQ91XT4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Sec16bQ91XT4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Sec16bQ91XT4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Sec16bQ91XT4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Sec16bQ91XT4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Sec16bQ91XT4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Sec16bQ91XT4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
Sec16bQ91XT4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Sec16bQ91XT4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Sec16bQ91XT4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Sec16bQ91XT4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Sec16bQ91XT4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Sec16bQ91XT4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Sec16bQ91XT4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Sec16bQ91XT4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Sec16bQ91XT4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Sec16bQ91XT4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Sec16bQ91XT4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms