Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36,76■■■■□ 3,48
Farp2Q91VS8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Farp2Q91VS8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Farp2Q91VS8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36,69■■■■□ 3,46
Farp2Q91VS8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Farp2Q91VS8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Farp2Q91VS8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Farp2Q91VS8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Farp2Q91VS8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Farp2Q91VS8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Farp2Q91VS8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Farp2Q91VS8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Farp2Q91VS8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Farp2Q91VS8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,49■■■■□ 3,43
Farp2Q91VS8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36,47■■■■□ 3,43
Farp2Q91VS8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Farp2Q91VS8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Farp2Q91VS8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Farp2Q91VS8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Farp2Q91VS8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Farp2Q91VS8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Farp2Q91VS8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Farp2Q91VS8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Farp2Q91VS8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Farp2Q91VS8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Farp2Q91VS8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,37■■■■□ 3,41
Farp2Q91VS8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36,36■■■■□ 3,41
Farp2Q91VS8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Farp2Q91VS8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Farp2Q91VS8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Farp2Q91VS8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Farp2Q91VS8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Farp2Q91VS8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36,3■■■■□ 3,4
Farp2Q91VS8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Farp2Q91VS8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Farp2Q91VS8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36,25■■■■□ 3,39
Farp2Q91VS8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Farp2Q91VS8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Farp2Q91VS8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Farp2Q91VS8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Farp2Q91VS8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Farp2Q91VS8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,22■■■■□ 3,39
Farp2Q91VS8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Farp2Q91VS8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36,21■■■■□ 3,39
Farp2Q91VS8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Farp2Q91VS8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Farp2Q91VS8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36,16■■■■□ 3,38
Farp2Q91VS8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Farp2Q91VS8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Farp2Q91VS8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Farp2Q91VS8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Farp2Q91VS8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Farp2Q91VS8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Farp2Q91VS8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Farp2Q91VS8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Farp2Q91VS8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Farp2Q91VS8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36,06■■■■□ 3,36
Farp2Q91VS8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Farp2Q91VS8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3,35
Farp2Q91VS8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Farp2Q91VS8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Farp2Q91VS8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Farp2Q91VS8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35,89■■■■□ 3,34
Farp2Q91VS8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Farp2Q91VS8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Farp2Q91VS8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Farp2Q91VS8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Farp2Q91VS8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,77■■■■□ 3,32
Farp2Q91VS8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Farp2Q91VS8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35,74■■■■□ 3,31
Farp2Q91VS8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Farp2Q91VS8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35,71■■■■□ 3,31
Farp2Q91VS8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35,71■■■■□ 3,31
Farp2Q91VS8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Farp2Q91VS8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Farp2Q91VS8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35,64■■■■□ 3,3
Farp2Q91VS8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Farp2Q91VS8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35,62■■■■□ 3,29
Farp2Q91VS8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Farp2Q91VS8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Farp2Q91VS8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Farp2Q91VS8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Farp2Q91VS8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35,57■■■■□ 3,28
Farp2Q91VS8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Farp2Q91VS8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Farp2Q91VS8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Farp2Q91VS8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Farp2Q91VS8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Farp2Q91VS8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Farp2Q91VS8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Farp2Q91VS8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Farp2Q91VS8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Farp2Q91VS8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Farp2Q91VS8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Farp2Q91VS8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Farp2Q91VS8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35,42■■■■□ 3,26
Farp2Q91VS8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Farp2Q91VS8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Farp2Q91VS8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Farp2Q91VS8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms