Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfxn3Q91V61 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfxn3Q91V61 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfxn3Q91V61 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfxn3Q91V61 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfxn3Q91V61 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfxn3Q91V61 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfxn3Q91V61 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfxn3Q91V61 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfxn3Q91V61 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfxn3Q91V61 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfxn3Q91V61 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfxn3Q91V61 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfxn3Q91V61 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfxn3Q91V61 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfxn3Q91V61 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfxn3Q91V61 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfxn3Q91V61 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sfxn3Q91V61 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfxn3Q91V61 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfxn3Q91V61 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfxn3Q91V61 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfxn3Q91V61 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfxn3Q91V61 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfxn3Q91V61 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfxn3Q91V61 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfxn3Q91V61 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfxn3Q91V61 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfxn3Q91V61 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfxn3Q91V61 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfxn3Q91V61 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfxn3Q91V61 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfxn3Q91V61 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfxn3Q91V61 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfxn3Q91V61 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sfxn3Q91V61 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfxn3Q91V61 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfxn3Q91V61 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfxn3Q91V61 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfxn3Q91V61 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfxn3Q91V61 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfxn3Q91V61 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfxn3Q91V61 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfxn3Q91V61 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfxn3Q91V61 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfxn3Q91V61 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfxn3Q91V61 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfxn3Q91V61 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfxn3Q91V61 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfxn3Q91V61 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfxn3Q91V61 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfxn3Q91V61 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfxn3Q91V61 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfxn3Q91V61 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfxn3Q91V61 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfxn3Q91V61 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfxn3Q91V61 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfxn3Q91V61 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sfxn3Q91V61 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfxn3Q91V61 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfxn3Q91V61 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn3Q91V61 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn3Q91V61 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn3Q91V61 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn3Q91V61 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms