Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc92Q8VDN4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc92Q8VDN4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc92Q8VDN4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc92Q8VDN4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc92Q8VDN4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc92Q8VDN4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc92Q8VDN4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc92Q8VDN4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc92Q8VDN4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc92Q8VDN4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc92Q8VDN4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc92Q8VDN4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc92Q8VDN4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc92Q8VDN4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc92Q8VDN4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc92Q8VDN4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc92Q8VDN4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc92Q8VDN4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc92Q8VDN4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc92Q8VDN4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc92Q8VDN4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc92Q8VDN4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc92Q8VDN4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc92Q8VDN4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc92Q8VDN4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc92Q8VDN4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc92Q8VDN4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc92Q8VDN4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc92Q8VDN4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc92Q8VDN4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc92Q8VDN4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc92Q8VDN4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc92Q8VDN4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc92Q8VDN4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms