Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1Q8VDF2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1Q8VDF2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Uhrf1Q8VDF2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uhrf1Q8VDF2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Uhrf1Q8VDF2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Uhrf1Q8VDF2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uhrf1Q8VDF2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1Q8VDF2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1Q8VDF2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uhrf1Q8VDF2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uhrf1Q8VDF2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uhrf1Q8VDF2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Uhrf1Q8VDF2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1Q8VDF2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1Q8VDF2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uhrf1Q8VDF2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1Q8VDF2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uhrf1Q8VDF2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uhrf1Q8VDF2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uhrf1Q8VDF2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1Q8VDF2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1Q8VDF2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1Q8VDF2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uhrf1Q8VDF2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1Q8VDF2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1Q8VDF2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1Q8VDF2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1Q8VDF2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Uhrf1Q8VDF2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1Q8VDF2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1Q8VDF2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1Q8VDF2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1Q8VDF2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1Q8VDF2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1Q8VDF2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1Q8VDF2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Uhrf1Q8VDF2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Uhrf1Q8VDF2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Uhrf1Q8VDF2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uhrf1Q8VDF2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Uhrf1Q8VDF2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uhrf1Q8VDF2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uhrf1Q8VDF2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1Q8VDF2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1Q8VDF2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1Q8VDF2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1Q8VDF2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1Q8VDF2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1Q8VDF2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1Q8VDF2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Uhrf1Q8VDF2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uhrf1Q8VDF2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uhrf1Q8VDF2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uhrf1Q8VDF2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1Q8VDF2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1Q8VDF2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Uhrf1Q8VDF2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uhrf1Q8VDF2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uhrf1Q8VDF2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uhrf1Q8VDF2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uhrf1Q8VDF2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uhrf1Q8VDF2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uhrf1Q8VDF2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uhrf1Q8VDF2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1Q8VDF2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1Q8VDF2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1Q8VDF2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1Q8VDF2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1Q8VDF2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1Q8VDF2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1Q8VDF2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1Q8VDF2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uhrf1Q8VDF2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Uhrf1Q8VDF2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Uhrf1Q8VDF2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uhrf1Q8VDF2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uhrf1Q8VDF2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uhrf1Q8VDF2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uhrf1Q8VDF2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uhrf1Q8VDF2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uhrf1Q8VDF2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uhrf1Q8VDF2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uhrf1Q8VDF2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uhrf1Q8VDF2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uhrf1Q8VDF2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uhrf1Q8VDF2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Uhrf1Q8VDF2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uhrf1Q8VDF2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uhrf1Q8VDF2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
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