Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dnajc28Q8VCE1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dnajc28Q8VCE1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnajc28Q8VCE1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnajc28Q8VCE1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnajc28Q8VCE1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnajc28Q8VCE1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnajc28Q8VCE1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dnajc28Q8VCE1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnajc28Q8VCE1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnajc28Q8VCE1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnajc28Q8VCE1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnajc28Q8VCE1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnajc28Q8VCE1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnajc28Q8VCE1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnajc28Q8VCE1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnajc28Q8VCE1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnajc28Q8VCE1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnajc28Q8VCE1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnajc28Q8VCE1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Dnajc28Q8VCE1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnajc28Q8VCE1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnajc28Q8VCE1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnajc28Q8VCE1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnajc28Q8VCE1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Dnajc28Q8VCE1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnajc28Q8VCE1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnajc28Q8VCE1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dnajc28Q8VCE1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnajc28Q8VCE1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnajc28Q8VCE1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnajc28Q8VCE1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnajc28Q8VCE1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnajc28Q8VCE1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnajc28Q8VCE1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Dnajc28Q8VCE1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dnajc28Q8VCE1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dnajc28Q8VCE1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnajc28Q8VCE1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnajc28Q8VCE1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnajc28Q8VCE1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnajc28Q8VCE1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnajc28Q8VCE1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnajc28Q8VCE1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnajc28Q8VCE1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnajc28Q8VCE1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnajc28Q8VCE1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dnajc28Q8VCE1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnajc28Q8VCE1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dnajc28Q8VCE1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnajc28Q8VCE1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnajc28Q8VCE1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnajc28Q8VCE1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Dnajc28Q8VCE1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dnajc28Q8VCE1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnajc28Q8VCE1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnajc28Q8VCE1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnajc28Q8VCE1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnajc28Q8VCE1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnajc28Q8VCE1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnajc28Q8VCE1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnajc28Q8VCE1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnajc28Q8VCE1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnajc28Q8VCE1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dnajc28Q8VCE1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnajc28Q8VCE1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnajc28Q8VCE1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnajc28Q8VCE1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnajc28Q8VCE1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnajc28Q8VCE1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnajc28Q8VCE1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnajc28Q8VCE1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnajc28Q8VCE1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnajc28Q8VCE1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnajc28Q8VCE1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnajc28Q8VCE1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnajc28Q8VCE1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dnajc28Q8VCE1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Dnajc28Q8VCE1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dnajc28Q8VCE1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnajc28Q8VCE1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnajc28Q8VCE1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dnajc28Q8VCE1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dnajc28Q8VCE1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dnajc28Q8VCE1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dnajc28Q8VCE1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms