Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gipc3Q8R5M0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gipc3Q8R5M0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gipc3Q8R5M0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gipc3Q8R5M0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gipc3Q8R5M0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gipc3Q8R5M0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gipc3Q8R5M0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gipc3Q8R5M0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gipc3Q8R5M0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gipc3Q8R5M0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gipc3Q8R5M0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gipc3Q8R5M0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gipc3Q8R5M0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gipc3Q8R5M0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gipc3Q8R5M0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gipc3Q8R5M0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gipc3Q8R5M0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gipc3Q8R5M0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gipc3Q8R5M0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gipc3Q8R5M0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gipc3Q8R5M0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gipc3Q8R5M0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gipc3Q8R5M0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gipc3Q8R5M0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gipc3Q8R5M0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gipc3Q8R5M0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gipc3Q8R5M0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gipc3Q8R5M0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gipc3Q8R5M0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gipc3Q8R5M0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gipc3Q8R5M0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gipc3Q8R5M0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gipc3Q8R5M0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gipc3Q8R5M0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gipc3Q8R5M0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gipc3Q8R5M0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gipc3Q8R5M0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gipc3Q8R5M0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gipc3Q8R5M0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gipc3Q8R5M0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gipc3Q8R5M0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gipc3Q8R5M0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gipc3Q8R5M0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gipc3Q8R5M0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gipc3Q8R5M0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gipc3Q8R5M0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gipc3Q8R5M0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gipc3Q8R5M0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gipc3Q8R5M0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gipc3Q8R5M0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gipc3Q8R5M0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gipc3Q8R5M0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gipc3Q8R5M0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gipc3Q8R5M0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gipc3Q8R5M0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gipc3Q8R5M0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gipc3Q8R5M0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gipc3Q8R5M0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gipc3Q8R5M0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gipc3Q8R5M0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gipc3Q8R5M0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gipc3Q8R5M0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gipc3Q8R5M0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gipc3Q8R5M0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gipc3Q8R5M0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gipc3Q8R5M0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms