Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b4Q8QZY9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b4Q8QZY9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b4Q8QZY9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b4Q8QZY9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b4Q8QZY9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b4Q8QZY9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b4Q8QZY9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b4Q8QZY9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b4Q8QZY9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b4Q8QZY9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b4Q8QZY9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b4Q8QZY9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b4Q8QZY9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b4Q8QZY9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b4Q8QZY9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b4Q8QZY9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b4Q8QZY9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b4Q8QZY9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sf3b4Q8QZY9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b4Q8QZY9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b4Q8QZY9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b4Q8QZY9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b4Q8QZY9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b4Q8QZY9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b4Q8QZY9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b4Q8QZY9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b4Q8QZY9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b4Q8QZY9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b4Q8QZY9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b4Q8QZY9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b4Q8QZY9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b4Q8QZY9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b4Q8QZY9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b4Q8QZY9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b4Q8QZY9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3b4Q8QZY9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b4Q8QZY9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b4Q8QZY9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b4Q8QZY9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b4Q8QZY9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b4Q8QZY9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b4Q8QZY9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b4Q8QZY9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b4Q8QZY9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b4Q8QZY9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b4Q8QZY9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b4Q8QZY9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b4Q8QZY9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b4Q8QZY9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b4Q8QZY9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b4Q8QZY9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b4Q8QZY9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b4Q8QZY9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b4Q8QZY9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b4Q8QZY9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b4Q8QZY9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b4Q8QZY9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b4Q8QZY9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b4Q8QZY9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b4Q8QZY9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b4Q8QZY9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b4Q8QZY9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b4Q8QZY9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b4Q8QZY9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b4Q8QZY9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b4Q8QZY9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b4Q8QZY9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b4Q8QZY9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b4Q8QZY9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b4Q8QZY9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b4Q8QZY9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b4Q8QZY9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b4Q8QZY9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b4Q8QZY9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b4Q8QZY9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b4Q8QZY9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b4Q8QZY9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b4Q8QZY9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms