Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sde2Q8K1J5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sde2Q8K1J5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Sde2Q8K1J5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sde2Q8K1J5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sde2Q8K1J5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sde2Q8K1J5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sde2Q8K1J5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sde2Q8K1J5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sde2Q8K1J5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sde2Q8K1J5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sde2Q8K1J5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Sde2Q8K1J5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sde2Q8K1J5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Sde2Q8K1J5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sde2Q8K1J5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sde2Q8K1J5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sde2Q8K1J5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sde2Q8K1J5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sde2Q8K1J5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sde2Q8K1J5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sde2Q8K1J5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sde2Q8K1J5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sde2Q8K1J5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sde2Q8K1J5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sde2Q8K1J5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sde2Q8K1J5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sde2Q8K1J5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sde2Q8K1J5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sde2Q8K1J5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sde2Q8K1J5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Sde2Q8K1J5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sde2Q8K1J5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sde2Q8K1J5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sde2Q8K1J5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sde2Q8K1J5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Sde2Q8K1J5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sde2Q8K1J5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sde2Q8K1J5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sde2Q8K1J5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sde2Q8K1J5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sde2Q8K1J5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sde2Q8K1J5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sde2Q8K1J5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sde2Q8K1J5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sde2Q8K1J5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sde2Q8K1J5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sde2Q8K1J5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sde2Q8K1J5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sde2Q8K1J5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Sde2Q8K1J5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sde2Q8K1J5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sde2Q8K1J5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sde2Q8K1J5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sde2Q8K1J5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sde2Q8K1J5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sde2Q8K1J5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sde2Q8K1J5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sde2Q8K1J5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Sde2Q8K1J5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sde2Q8K1J5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sde2Q8K1J5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sde2Q8K1J5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sde2Q8K1J5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sde2Q8K1J5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sde2Q8K1J5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sde2Q8K1J5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sde2Q8K1J5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sde2Q8K1J5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sde2Q8K1J5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sde2Q8K1J5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sde2Q8K1J5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sde2Q8K1J5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sde2Q8K1J5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sde2Q8K1J5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sde2Q8K1J5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sde2Q8K1J5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Sde2Q8K1J5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sde2Q8K1J5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sde2Q8K1J5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Sde2Q8K1J5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Sde2Q8K1J5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sde2Q8K1J5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sde2Q8K1J5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sde2Q8K1J5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sde2Q8K1J5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Sde2Q8K1J5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Sde2Q8K1J5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Sde2Q8K1J5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sde2Q8K1J5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Sde2Q8K1J5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Sde2Q8K1J5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sde2Q8K1J5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sde2Q8K1J5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sde2Q8K1J5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sde2Q8K1J5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Sde2Q8K1J5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sde2Q8K1J5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sde2Q8K1J5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sde2Q8K1J5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms