Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Trim61Q8JZK6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Trim61Q8JZK6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Trim61Q8JZK6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Trim61Q8JZK6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Trim61Q8JZK6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Trim61Q8JZK6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Trim61Q8JZK6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Trim61Q8JZK6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Trim61Q8JZK6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Trim61Q8JZK6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Trim61Q8JZK6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Trim61Q8JZK6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Trim61Q8JZK6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Trim61Q8JZK6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Trim61Q8JZK6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,76■■■□□ 2,04
Trim61Q8JZK6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Trim61Q8JZK6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Trim61Q8JZK6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Trim61Q8JZK6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Trim61Q8JZK6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Trim61Q8JZK6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Trim61Q8JZK6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Trim61Q8JZK6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Trim61Q8JZK6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Trim61Q8JZK6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Trim61Q8JZK6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trim61Q8JZK6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trim61Q8JZK6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trim61Q8JZK6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trim61Q8JZK6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trim61Q8JZK6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Trim61Q8JZK6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Trim61Q8JZK6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Trim61Q8JZK6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Trim61Q8JZK6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Trim61Q8JZK6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Trim61Q8JZK6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Trim61Q8JZK6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Trim61Q8JZK6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Trim61Q8JZK6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trim61Q8JZK6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trim61Q8JZK6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Trim61Q8JZK6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Trim61Q8JZK6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Trim61Q8JZK6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,45■■□□□ 1,98
Trim61Q8JZK6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Trim61Q8JZK6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Trim61Q8JZK6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Trim61Q8JZK6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Trim61Q8JZK6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Trim61Q8JZK6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Trim61Q8JZK6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Trim61Q8JZK6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Trim61Q8JZK6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Trim61Q8JZK6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Trim61Q8JZK6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Trim61Q8JZK6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Trim61Q8JZK6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,96
Trim61Q8JZK6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Trim61Q8JZK6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Trim61Q8JZK6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Trim61Q8JZK6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Trim61Q8JZK6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Trim61Q8JZK6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Trim61Q8JZK6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Trim61Q8JZK6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Trim61Q8JZK6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Trim61Q8JZK6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Trim61Q8JZK6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Trim61Q8JZK6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Trim61Q8JZK6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Trim61Q8JZK6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Trim61Q8JZK6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Trim61Q8JZK6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Trim61Q8JZK6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Trim61Q8JZK6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Trim61Q8JZK6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Trim61Q8JZK6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Trim61Q8JZK6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,92
Trim61Q8JZK6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Trim61Q8JZK6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Trim61Q8JZK6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Trim61Q8JZK6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Trim61Q8JZK6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Trim61Q8JZK6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Trim61Q8JZK6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Trim61Q8JZK6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Trim61Q8JZK6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms