Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHY7

Ttc23, Tetratricopeptide repeat protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23Q8CHY7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc23Q8CHY7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc23Q8CHY7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc23Q8CHY7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc23Q8CHY7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc23Q8CHY7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc23Q8CHY7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc23Q8CHY7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc23Q8CHY7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc23Q8CHY7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc23Q8CHY7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc23Q8CHY7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc23Q8CHY7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc23Q8CHY7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc23Q8CHY7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc23Q8CHY7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc23Q8CHY7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc23Q8CHY7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc23Q8CHY7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc23Q8CHY7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc23Q8CHY7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc23Q8CHY7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc23Q8CHY7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ttc23Q8CHY7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc23Q8CHY7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc23Q8CHY7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc23Q8CHY7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc23Q8CHY7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc23Q8CHY7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc23Q8CHY7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc23Q8CHY7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc23Q8CHY7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc23Q8CHY7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc23Q8CHY7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc23Q8CHY7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc23Q8CHY7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc23Q8CHY7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc23Q8CHY7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc23Q8CHY7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc23Q8CHY7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc23Q8CHY7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc23Q8CHY7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc23Q8CHY7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc23Q8CHY7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc23Q8CHY7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc23Q8CHY7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc23Q8CHY7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc23Q8CHY7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc23Q8CHY7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc23Q8CHY7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc23Q8CHY7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc23Q8CHY7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc23Q8CHY7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc23Q8CHY7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc23Q8CHY7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc23Q8CHY7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc23Q8CHY7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc23Q8CHY7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc23Q8CHY7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc23Q8CHY7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc23Q8CHY7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc23Q8CHY7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc23Q8CHY7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc23Q8CHY7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc23Q8CHY7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc23Q8CHY7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc23Q8CHY7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc23Q8CHY7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc23Q8CHY7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc23Q8CHY7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc23Q8CHY7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc23Q8CHY7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc23Q8CHY7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc23Q8CHY7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc23Q8CHY7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc23Q8CHY7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc23Q8CHY7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc23Q8CHY7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms