Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FarsaQ8C0C7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FarsaQ8C0C7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FarsaQ8C0C7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FarsaQ8C0C7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FarsaQ8C0C7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FarsaQ8C0C7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FarsaQ8C0C7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FarsaQ8C0C7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FarsaQ8C0C7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FarsaQ8C0C7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FarsaQ8C0C7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FarsaQ8C0C7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FarsaQ8C0C7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FarsaQ8C0C7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FarsaQ8C0C7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FarsaQ8C0C7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FarsaQ8C0C7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FarsaQ8C0C7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FarsaQ8C0C7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FarsaQ8C0C7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FarsaQ8C0C7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FarsaQ8C0C7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FarsaQ8C0C7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FarsaQ8C0C7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FarsaQ8C0C7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FarsaQ8C0C7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FarsaQ8C0C7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FarsaQ8C0C7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FarsaQ8C0C7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FarsaQ8C0C7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FarsaQ8C0C7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FarsaQ8C0C7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FarsaQ8C0C7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FarsaQ8C0C7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FarsaQ8C0C7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FarsaQ8C0C7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FarsaQ8C0C7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FarsaQ8C0C7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FarsaQ8C0C7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FarsaQ8C0C7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FarsaQ8C0C7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FarsaQ8C0C7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FarsaQ8C0C7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FarsaQ8C0C7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FarsaQ8C0C7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FarsaQ8C0C7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FarsaQ8C0C7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FarsaQ8C0C7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FarsaQ8C0C7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FarsaQ8C0C7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FarsaQ8C0C7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FarsaQ8C0C7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FarsaQ8C0C7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FarsaQ8C0C7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FarsaQ8C0C7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FarsaQ8C0C7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FarsaQ8C0C7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FarsaQ8C0C7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FarsaQ8C0C7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FarsaQ8C0C7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FarsaQ8C0C7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FarsaQ8C0C7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FarsaQ8C0C7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FarsaQ8C0C7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FarsaQ8C0C7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FarsaQ8C0C7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FarsaQ8C0C7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FarsaQ8C0C7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FarsaQ8C0C7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FarsaQ8C0C7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FarsaQ8C0C7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FarsaQ8C0C7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FarsaQ8C0C7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FarsaQ8C0C7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FarsaQ8C0C7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FarsaQ8C0C7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FarsaQ8C0C7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FarsaQ8C0C7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FarsaQ8C0C7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FarsaQ8C0C7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FarsaQ8C0C7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms