Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tyw3Q8BSA9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tyw3Q8BSA9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tyw3Q8BSA9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tyw3Q8BSA9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tyw3Q8BSA9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tyw3Q8BSA9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tyw3Q8BSA9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tyw3Q8BSA9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tyw3Q8BSA9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tyw3Q8BSA9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tyw3Q8BSA9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tyw3Q8BSA9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tyw3Q8BSA9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tyw3Q8BSA9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tyw3Q8BSA9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tyw3Q8BSA9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tyw3Q8BSA9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tyw3Q8BSA9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tyw3Q8BSA9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tyw3Q8BSA9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tyw3Q8BSA9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tyw3Q8BSA9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tyw3Q8BSA9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tyw3Q8BSA9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tyw3Q8BSA9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tyw3Q8BSA9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tyw3Q8BSA9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tyw3Q8BSA9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tyw3Q8BSA9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tyw3Q8BSA9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tyw3Q8BSA9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tyw3Q8BSA9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tyw3Q8BSA9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tyw3Q8BSA9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tyw3Q8BSA9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tyw3Q8BSA9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tyw3Q8BSA9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tyw3Q8BSA9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tyw3Q8BSA9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tyw3Q8BSA9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tyw3Q8BSA9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tyw3Q8BSA9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tyw3Q8BSA9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tyw3Q8BSA9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tyw3Q8BSA9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tyw3Q8BSA9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tyw3Q8BSA9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tyw3Q8BSA9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tyw3Q8BSA9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tyw3Q8BSA9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tyw3Q8BSA9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tyw3Q8BSA9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tyw3Q8BSA9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tyw3Q8BSA9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tyw3Q8BSA9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tyw3Q8BSA9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tyw3Q8BSA9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tyw3Q8BSA9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tyw3Q8BSA9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tyw3Q8BSA9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tyw3Q8BSA9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tyw3Q8BSA9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tyw3Q8BSA9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tyw3Q8BSA9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tyw3Q8BSA9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tyw3Q8BSA9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tyw3Q8BSA9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tyw3Q8BSA9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tyw3Q8BSA9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tyw3Q8BSA9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tyw3Q8BSA9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tyw3Q8BSA9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tyw3Q8BSA9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tyw3Q8BSA9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tyw3Q8BSA9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tyw3Q8BSA9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms