Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prox2Q8BII1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prox2Q8BII1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prox2Q8BII1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prox2Q8BII1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prox2Q8BII1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prox2Q8BII1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prox2Q8BII1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prox2Q8BII1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Prox2Q8BII1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prox2Q8BII1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prox2Q8BII1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prox2Q8BII1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prox2Q8BII1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prox2Q8BII1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prox2Q8BII1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prox2Q8BII1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Prox2Q8BII1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prox2Q8BII1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prox2Q8BII1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prox2Q8BII1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prox2Q8BII1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prox2Q8BII1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prox2Q8BII1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prox2Q8BII1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prox2Q8BII1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prox2Q8BII1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prox2Q8BII1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prox2Q8BII1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prox2Q8BII1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prox2Q8BII1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prox2Q8BII1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prox2Q8BII1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prox2Q8BII1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prox2Q8BII1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prox2Q8BII1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prox2Q8BII1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prox2Q8BII1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prox2Q8BII1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prox2Q8BII1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prox2Q8BII1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prox2Q8BII1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prox2Q8BII1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prox2Q8BII1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prox2Q8BII1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prox2Q8BII1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prox2Q8BII1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prox2Q8BII1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prox2Q8BII1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prox2Q8BII1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prox2Q8BII1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prox2Q8BII1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prox2Q8BII1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prox2Q8BII1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prox2Q8BII1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prox2Q8BII1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prox2Q8BII1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prox2Q8BII1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prox2Q8BII1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prox2Q8BII1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prox2Q8BII1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prox2Q8BII1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prox2Q8BII1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prox2Q8BII1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prox2Q8BII1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prox2Q8BII1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prox2Q8BII1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prox2Q8BII1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prox2Q8BII1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prox2Q8BII1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prox2Q8BII1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prox2Q8BII1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prox2Q8BII1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prox2Q8BII1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prox2Q8BII1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prox2Q8BII1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prox2Q8BII1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prox2Q8BII1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prox2Q8BII1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prox2Q8BII1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prox2Q8BII1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prox2Q8BII1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prox2Q8BII1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prox2Q8BII1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prox2Q8BII1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prox2Q8BII1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prox2Q8BII1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prox2Q8BII1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prox2Q8BII1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms