Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI41

Synb, Syncytin-B, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynbQ8BI41 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SynbQ8BI41 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynbQ8BI41 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SynbQ8BI41 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynbQ8BI41 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynbQ8BI41 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynbQ8BI41 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SynbQ8BI41 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynbQ8BI41 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SynbQ8BI41 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynbQ8BI41 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SynbQ8BI41 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SynbQ8BI41 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynbQ8BI41 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynbQ8BI41 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynbQ8BI41 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynbQ8BI41 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynbQ8BI41 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynbQ8BI41 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynbQ8BI41 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynbQ8BI41 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynbQ8BI41 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynbQ8BI41 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynbQ8BI41 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynbQ8BI41 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynbQ8BI41 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SynbQ8BI41 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SynbQ8BI41 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SynbQ8BI41 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynbQ8BI41 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynbQ8BI41 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynbQ8BI41 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynbQ8BI41 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynbQ8BI41 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynbQ8BI41 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynbQ8BI41 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynbQ8BI41 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynbQ8BI41 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynbQ8BI41 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SynbQ8BI41 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynbQ8BI41 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynbQ8BI41 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynbQ8BI41 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SynbQ8BI41 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynbQ8BI41 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynbQ8BI41 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SynbQ8BI41 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SynbQ8BI41 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SynbQ8BI41 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynbQ8BI41 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynbQ8BI41 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynbQ8BI41 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynbQ8BI41 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynbQ8BI41 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynbQ8BI41 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynbQ8BI41 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynbQ8BI41 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SynbQ8BI41 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynbQ8BI41 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynbQ8BI41 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynbQ8BI41 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynbQ8BI41 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynbQ8BI41 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynbQ8BI41 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynbQ8BI41 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynbQ8BI41 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynbQ8BI41 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SynbQ8BI41 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynbQ8BI41 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynbQ8BI41 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynbQ8BI41 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynbQ8BI41 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynbQ8BI41 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynbQ8BI41 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynbQ8BI41 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynbQ8BI41 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynbQ8BI41 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynbQ8BI41 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynbQ8BI41 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynbQ8BI41 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynbQ8BI41 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynbQ8BI41 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynbQ8BI41 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynbQ8BI41 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms