Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Susd4Q8BH32 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Susd4Q8BH32 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Susd4Q8BH32 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Susd4Q8BH32 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Susd4Q8BH32 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Susd4Q8BH32 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Susd4Q8BH32 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Susd4Q8BH32 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Susd4Q8BH32 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Susd4Q8BH32 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Susd4Q8BH32 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Susd4Q8BH32 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Susd4Q8BH32 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Susd4Q8BH32 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Susd4Q8BH32 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Susd4Q8BH32 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Susd4Q8BH32 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Susd4Q8BH32 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Susd4Q8BH32 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Susd4Q8BH32 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Susd4Q8BH32 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Susd4Q8BH32 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Susd4Q8BH32 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Susd4Q8BH32 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Susd4Q8BH32 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Susd4Q8BH32 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Susd4Q8BH32 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Susd4Q8BH32 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Susd4Q8BH32 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Susd4Q8BH32 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Susd4Q8BH32 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Susd4Q8BH32 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Susd4Q8BH32 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Susd4Q8BH32 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Susd4Q8BH32 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Susd4Q8BH32 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Susd4Q8BH32 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Susd4Q8BH32 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Susd4Q8BH32 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Susd4Q8BH32 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Susd4Q8BH32 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Susd4Q8BH32 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Susd4Q8BH32 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Susd4Q8BH32 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Susd4Q8BH32 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Susd4Q8BH32 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Susd4Q8BH32 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Susd4Q8BH32 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Susd4Q8BH32 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Susd4Q8BH32 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Susd4Q8BH32 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Susd4Q8BH32 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Susd4Q8BH32 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Susd4Q8BH32 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Susd4Q8BH32 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Susd4Q8BH32 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Susd4Q8BH32 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Susd4Q8BH32 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Susd4Q8BH32 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Susd4Q8BH32 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Susd4Q8BH32 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Susd4Q8BH32 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Susd4Q8BH32 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Susd4Q8BH32 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Susd4Q8BH32 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Susd4Q8BH32 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Susd4Q8BH32 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Susd4Q8BH32 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Susd4Q8BH32 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Susd4Q8BH32 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Susd4Q8BH32 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Susd4Q8BH32 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Susd4Q8BH32 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Susd4Q8BH32 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Susd4Q8BH32 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Susd4Q8BH32 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Susd4Q8BH32 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Susd4Q8BH32 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Susd4Q8BH32 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Susd4Q8BH32 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Susd4Q8BH32 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Susd4Q8BH32 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Susd4Q8BH32 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Susd4Q8BH32 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Susd4Q8BH32 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Susd4Q8BH32 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Susd4Q8BH32 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Susd4Q8BH32 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Susd4Q8BH32 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Susd4Q8BH32 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Susd4Q8BH32 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Susd4Q8BH32 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Susd4Q8BH32 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Susd4Q8BH32 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Susd4Q8BH32 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Susd4Q8BH32 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Susd4Q8BH32 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Susd4Q8BH32 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Susd4Q8BH32 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms