Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc50Q810U5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc50Q810U5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc50Q810U5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc50Q810U5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc50Q810U5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc50Q810U5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc50Q810U5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc50Q810U5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc50Q810U5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc50Q810U5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc50Q810U5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc50Q810U5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc50Q810U5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc50Q810U5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc50Q810U5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc50Q810U5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc50Q810U5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc50Q810U5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc50Q810U5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc50Q810U5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc50Q810U5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc50Q810U5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc50Q810U5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc50Q810U5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc50Q810U5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc50Q810U5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc50Q810U5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc50Q810U5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc50Q810U5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc50Q810U5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc50Q810U5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc50Q810U5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc50Q810U5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc50Q810U5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc50Q810U5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc50Q810U5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc50Q810U5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc50Q810U5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc50Q810U5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc50Q810U5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc50Q810U5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc50Q810U5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc50Q810U5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc50Q810U5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc50Q810U5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc50Q810U5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc50Q810U5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc50Q810U5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc50Q810U5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc50Q810U5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc50Q810U5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc50Q810U5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc50Q810U5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc50Q810U5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc50Q810U5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc50Q810U5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc50Q810U5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc50Q810U5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc50Q810U5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc50Q810U5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc50Q810U5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc50Q810U5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc50Q810U5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc50Q810U5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc50Q810U5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc50Q810U5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc50Q810U5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc50Q810U5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc50Q810U5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc50Q810U5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc50Q810U5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc50Q810U5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc50Q810U5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc50Q810U5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc50Q810U5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc50Q810U5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc50Q810U5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc50Q810U5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc50Q810U5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc50Q810U5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc50Q810U5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc50Q810U5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc50Q810U5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms