Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y39

Uncharacterized protein C10orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y39 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q80Y39 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q80Y39 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q80Y39 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q80Y39 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q80Y39 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q80Y39 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q80Y39 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q80Y39 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q80Y39 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q80Y39 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q80Y39 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q80Y39 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q80Y39 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q80Y39 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q80Y39 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q80Y39 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q80Y39 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q80Y39 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q80Y39 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q80Y39 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q80Y39 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q80Y39 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q80Y39 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q80Y39 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y39 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q80Y39 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q80Y39 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q80Y39 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q80Y39 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q80Y39 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q80Y39 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q80Y39 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q80Y39 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q80Y39 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q80Y39 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q80Y39 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q80Y39 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q80Y39 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q80Y39 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q80Y39 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q80Y39 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q80Y39 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q80Y39 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q80Y39 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q80Y39 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q80Y39 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q80Y39 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q80Y39 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q80Y39 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q80Y39 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q80Y39 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q80Y39 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q80Y39 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q80Y39 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q80Y39 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q80Y39 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q80Y39 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q80Y39 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q80Y39 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q80Y39 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q80Y39 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q80Y39 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q80Y39 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q80Y39 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q80Y39 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q80Y39 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q80Y39 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q80Y39 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q80Y39 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q80Y39 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q80Y39 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q80Y39 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q80Y39 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q80Y39 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q80Y39 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q80Y39 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q80Y39 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q80Y39 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q80Y39 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q80Y39 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q80Y39 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q80Y39 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q80Y39 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q80Y39 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q80Y39 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q80Y39 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q80Y39 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q80Y39 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q80Y39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q80Y39 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q80Y39 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q80Y39 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q80Y39 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q80Y39 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q80Y39 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q80Y39 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q80Y39 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q80Y39 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q80Y39 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms