Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc1Q80VQ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc1Q80VQ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc1Q80VQ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc1Q80VQ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc1Q80VQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc1Q80VQ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc1Q80VQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc1Q80VQ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc1Q80VQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc1Q80VQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc1Q80VQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc1Q80VQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc1Q80VQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc1Q80VQ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc1Q80VQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrrc1Q80VQ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrrc1Q80VQ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc1Q80VQ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc1Q80VQ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc1Q80VQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc1Q80VQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc1Q80VQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc1Q80VQ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc1Q80VQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc1Q80VQ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc1Q80VQ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc1Q80VQ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc1Q80VQ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc1Q80VQ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc1Q80VQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc1Q80VQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc1Q80VQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc1Q80VQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc1Q80VQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc1Q80VQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc1Q80VQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc1Q80VQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrrc1Q80VQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrrc1Q80VQ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrc1Q80VQ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrc1Q80VQ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrc1Q80VQ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrc1Q80VQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrrc1Q80VQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrc1Q80VQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lrrc1Q80VQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrrc1Q80VQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrrc1Q80VQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrrc1Q80VQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrrc1Q80VQ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc1Q80VQ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc1Q80VQ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc1Q80VQ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc1Q80VQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc1Q80VQ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc1Q80VQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc1Q80VQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc1Q80VQ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc1Q80VQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc1Q80VQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc1Q80VQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc1Q80VQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc1Q80VQ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc1Q80VQ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc1Q80VQ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc1Q80VQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc1Q80VQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc1Q80VQ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc1Q80VQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc1Q80VQ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc1Q80VQ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc1Q80VQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc1Q80VQ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc1Q80VQ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc1Q80VQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc1Q80VQ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc1Q80VQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc1Q80VQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc1Q80VQ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc1Q80VQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc1Q80VQ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Lrrc1Q80VQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc1Q80VQ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc1Q80VQ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc1Q80VQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc1Q80VQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc1Q80VQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc1Q80VQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Lrrc1Q80VQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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