Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sbno2Q7TNB8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sbno2Q7TNB8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sbno2Q7TNB8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sbno2Q7TNB8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sbno2Q7TNB8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sbno2Q7TNB8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sbno2Q7TNB8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sbno2Q7TNB8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sbno2Q7TNB8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sbno2Q7TNB8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Sbno2Q7TNB8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sbno2Q7TNB8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sbno2Q7TNB8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sbno2Q7TNB8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sbno2Q7TNB8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sbno2Q7TNB8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sbno2Q7TNB8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Sbno2Q7TNB8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sbno2Q7TNB8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sbno2Q7TNB8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sbno2Q7TNB8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sbno2Q7TNB8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sbno2Q7TNB8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sbno2Q7TNB8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sbno2Q7TNB8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sbno2Q7TNB8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sbno2Q7TNB8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sbno2Q7TNB8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sbno2Q7TNB8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sbno2Q7TNB8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sbno2Q7TNB8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Sbno2Q7TNB8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sbno2Q7TNB8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sbno2Q7TNB8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sbno2Q7TNB8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sbno2Q7TNB8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sbno2Q7TNB8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sbno2Q7TNB8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno2Q7TNB8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno2Q7TNB8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sbno2Q7TNB8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sbno2Q7TNB8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sbno2Q7TNB8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sbno2Q7TNB8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sbno2Q7TNB8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sbno2Q7TNB8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sbno2Q7TNB8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sbno2Q7TNB8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sbno2Q7TNB8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sbno2Q7TNB8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sbno2Q7TNB8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sbno2Q7TNB8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sbno2Q7TNB8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sbno2Q7TNB8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno2Q7TNB8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno2Q7TNB8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno2Q7TNB8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sbno2Q7TNB8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sbno2Q7TNB8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sbno2Q7TNB8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sbno2Q7TNB8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sbno2Q7TNB8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sbno2Q7TNB8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sbno2Q7TNB8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sbno2Q7TNB8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sbno2Q7TNB8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sbno2Q7TNB8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sbno2Q7TNB8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sbno2Q7TNB8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sbno2Q7TNB8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sbno2Q7TNB8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sbno2Q7TNB8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sbno2Q7TNB8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sbno2Q7TNB8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sbno2Q7TNB8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sbno2Q7TNB8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sbno2Q7TNB8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sbno2Q7TNB8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sbno2Q7TNB8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sbno2Q7TNB8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Sbno2Q7TNB8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sbno2Q7TNB8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sbno2Q7TNB8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sbno2Q7TNB8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sbno2Q7TNB8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sbno2Q7TNB8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sbno2Q7TNB8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno2Q7TNB8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno2Q7TNB8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno2Q7TNB8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno2Q7TNB8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sbno2Q7TNB8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sbno2Q7TNB8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sbno2Q7TNB8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sbno2Q7TNB8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sbno2Q7TNB8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sbno2Q7TNB8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sbno2Q7TNB8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms