Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syne2Q6ZWQ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syne2Q6ZWQ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syne2Q6ZWQ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syne2Q6ZWQ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syne2Q6ZWQ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syne2Q6ZWQ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syne2Q6ZWQ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syne2Q6ZWQ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syne2Q6ZWQ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syne2Q6ZWQ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syne2Q6ZWQ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syne2Q6ZWQ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syne2Q6ZWQ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syne2Q6ZWQ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syne2Q6ZWQ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syne2Q6ZWQ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syne2Q6ZWQ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syne2Q6ZWQ0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Syne2Q6ZWQ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syne2Q6ZWQ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syne2Q6ZWQ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syne2Q6ZWQ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syne2Q6ZWQ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syne2Q6ZWQ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syne2Q6ZWQ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syne2Q6ZWQ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syne2Q6ZWQ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syne2Q6ZWQ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syne2Q6ZWQ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syne2Q6ZWQ0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syne2Q6ZWQ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syne2Q6ZWQ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syne2Q6ZWQ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syne2Q6ZWQ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syne2Q6ZWQ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syne2Q6ZWQ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Syne2Q6ZWQ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syne2Q6ZWQ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syne2Q6ZWQ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syne2Q6ZWQ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syne2Q6ZWQ0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syne2Q6ZWQ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syne2Q6ZWQ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syne2Q6ZWQ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syne2Q6ZWQ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syne2Q6ZWQ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syne2Q6ZWQ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syne2Q6ZWQ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syne2Q6ZWQ0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syne2Q6ZWQ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syne2Q6ZWQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syne2Q6ZWQ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syne2Q6ZWQ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syne2Q6ZWQ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syne2Q6ZWQ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syne2Q6ZWQ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Syne2Q6ZWQ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syne2Q6ZWQ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syne2Q6ZWQ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms