Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NfrkbQ6PIJ4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NfrkbQ6PIJ4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NfrkbQ6PIJ4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NfrkbQ6PIJ4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NfrkbQ6PIJ4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NfrkbQ6PIJ4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NfrkbQ6PIJ4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NfrkbQ6PIJ4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NfrkbQ6PIJ4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NfrkbQ6PIJ4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NfrkbQ6PIJ4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NfrkbQ6PIJ4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NfrkbQ6PIJ4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NfrkbQ6PIJ4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NfrkbQ6PIJ4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NfrkbQ6PIJ4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NfrkbQ6PIJ4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NfrkbQ6PIJ4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NfrkbQ6PIJ4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NfrkbQ6PIJ4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NfrkbQ6PIJ4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NfrkbQ6PIJ4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NfrkbQ6PIJ4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NfrkbQ6PIJ4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NfrkbQ6PIJ4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NfrkbQ6PIJ4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NfrkbQ6PIJ4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NfrkbQ6PIJ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NfrkbQ6PIJ4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NfrkbQ6PIJ4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NfrkbQ6PIJ4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NfrkbQ6PIJ4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NfrkbQ6PIJ4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NfrkbQ6PIJ4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NfrkbQ6PIJ4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NfrkbQ6PIJ4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NfrkbQ6PIJ4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NfrkbQ6PIJ4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NfrkbQ6PIJ4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NfrkbQ6PIJ4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NfrkbQ6PIJ4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NfrkbQ6PIJ4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NfrkbQ6PIJ4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NfrkbQ6PIJ4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NfrkbQ6PIJ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NfrkbQ6PIJ4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NfrkbQ6PIJ4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NfrkbQ6PIJ4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NfrkbQ6PIJ4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NfrkbQ6PIJ4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NfrkbQ6PIJ4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NfrkbQ6PIJ4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NfrkbQ6PIJ4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NfrkbQ6PIJ4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NfrkbQ6PIJ4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NfrkbQ6PIJ4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NfrkbQ6PIJ4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NfrkbQ6PIJ4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NfrkbQ6PIJ4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NfrkbQ6PIJ4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NfrkbQ6PIJ4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NfrkbQ6PIJ4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NfrkbQ6PIJ4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NfrkbQ6PIJ4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NfrkbQ6PIJ4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NfrkbQ6PIJ4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NfrkbQ6PIJ4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NfrkbQ6PIJ4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NfrkbQ6PIJ4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NfrkbQ6PIJ4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NfrkbQ6PIJ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NfrkbQ6PIJ4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NfrkbQ6PIJ4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NfrkbQ6PIJ4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NfrkbQ6PIJ4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NfrkbQ6PIJ4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NfrkbQ6PIJ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NfrkbQ6PIJ4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NfrkbQ6PIJ4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NfrkbQ6PIJ4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NfrkbQ6PIJ4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NfrkbQ6PIJ4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NfrkbQ6PIJ4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NfrkbQ6PIJ4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NfrkbQ6PIJ4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NfrkbQ6PIJ4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NfrkbQ6PIJ4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NfrkbQ6PIJ4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NfrkbQ6PIJ4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NfrkbQ6PIJ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NfrkbQ6PIJ4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NfrkbQ6PIJ4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NfrkbQ6PIJ4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NfrkbQ6PIJ4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NfrkbQ6PIJ4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NfrkbQ6PIJ4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NfrkbQ6PIJ4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms