Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Atp1a2Q6PIE5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Atp1a2Q6PIE5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Atp1a2Q6PIE5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Atp1a2Q6PIE5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Atp1a2Q6PIE5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Atp1a2Q6PIE5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Atp1a2Q6PIE5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Atp1a2Q6PIE5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Atp1a2Q6PIE5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Atp1a2Q6PIE5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Atp1a2Q6PIE5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Atp1a2Q6PIE5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,53■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Atp1a2Q6PIE5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Atp1a2Q6PIE5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Atp1a2Q6PIE5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Atp1a2Q6PIE5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Atp1a2Q6PIE5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Atp1a2Q6PIE5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Atp1a2Q6PIE5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Atp1a2Q6PIE5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Atp1a2Q6PIE5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Atp1a2Q6PIE5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Atp1a2Q6PIE5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Atp1a2Q6PIE5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Atp1a2Q6PIE5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Atp1a2Q6PIE5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Atp1a2Q6PIE5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Atp1a2Q6PIE5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Atp1a2Q6PIE5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Atp1a2Q6PIE5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Atp1a2Q6PIE5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Atp1a2Q6PIE5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Atp1a2Q6PIE5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Atp1a2Q6PIE5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Atp1a2Q6PIE5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Atp1a2Q6PIE5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Atp1a2Q6PIE5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Atp1a2Q6PIE5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Atp1a2Q6PIE5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Atp1a2Q6PIE5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Atp1a2Q6PIE5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Atp1a2Q6PIE5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Atp1a2Q6PIE5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Atp1a2Q6PIE5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Atp1a2Q6PIE5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Atp1a2Q6PIE5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Atp1a2Q6PIE5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Atp1a2Q6PIE5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Atp1a2Q6PIE5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Atp1a2Q6PIE5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Atp1a2Q6PIE5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Atp1a2Q6PIE5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Atp1a2Q6PIE5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Atp1a2Q6PIE5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Atp1a2Q6PIE5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Atp1a2Q6PIE5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,95
Atp1a2Q6PIE5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Atp1a2Q6PIE5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Atp1a2Q6PIE5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Atp1a2Q6PIE5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Atp1a2Q6PIE5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Atp1a2Q6PIE5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Atp1a2Q6PIE5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Atp1a2Q6PIE5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Atp1a2Q6PIE5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Atp1a2Q6PIE5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Atp1a2Q6PIE5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Atp1a2Q6PIE5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Atp1a2Q6PIE5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Atp1a2Q6PIE5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Atp1a2Q6PIE5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Atp1a2Q6PIE5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Atp1a2Q6PIE5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Atp1a2Q6PIE5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Atp1a2Q6PIE5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,91
Atp1a2Q6PIE5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Atp1a2Q6PIE5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Atp1a2Q6PIE5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Atp1a2Q6PIE5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Atp1a2Q6PIE5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms