Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1a2Q6PIE5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1a2Q6PIE5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1a2Q6PIE5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1a2Q6PIE5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1a2Q6PIE5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1a2Q6PIE5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1a2Q6PIE5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1a2Q6PIE5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1a2Q6PIE5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1a2Q6PIE5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1a2Q6PIE5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1a2Q6PIE5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Atp1a2Q6PIE5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1a2Q6PIE5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1a2Q6PIE5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1a2Q6PIE5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1a2Q6PIE5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1a2Q6PIE5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1a2Q6PIE5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1a2Q6PIE5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atp1a2Q6PIE5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1a2Q6PIE5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1a2Q6PIE5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1a2Q6PIE5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp1a2Q6PIE5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1a2Q6PIE5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1a2Q6PIE5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1a2Q6PIE5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1a2Q6PIE5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1a2Q6PIE5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1a2Q6PIE5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atp1a2Q6PIE5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1a2Q6PIE5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1a2Q6PIE5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1a2Q6PIE5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1a2Q6PIE5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1a2Q6PIE5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1a2Q6PIE5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1a2Q6PIE5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1a2Q6PIE5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1a2Q6PIE5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1a2Q6PIE5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1a2Q6PIE5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1a2Q6PIE5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1a2Q6PIE5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1a2Q6PIE5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1a2Q6PIE5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1a2Q6PIE5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1a2Q6PIE5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1a2Q6PIE5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1a2Q6PIE5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1a2Q6PIE5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1a2Q6PIE5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp1a2Q6PIE5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp1a2Q6PIE5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1a2Q6PIE5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1a2Q6PIE5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp1a2Q6PIE5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1a2Q6PIE5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1a2Q6PIE5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1a2Q6PIE5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp1a2Q6PIE5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1a2Q6PIE5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1a2Q6PIE5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1a2Q6PIE5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1a2Q6PIE5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1a2Q6PIE5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1a2Q6PIE5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1a2Q6PIE5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1a2Q6PIE5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1a2Q6PIE5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1a2Q6PIE5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1a2Q6PIE5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1a2Q6PIE5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1a2Q6PIE5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1a2Q6PIE5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp1a2Q6PIE5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1a2Q6PIE5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1a2Q6PIE5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1a2Q6PIE5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1a2Q6PIE5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms