Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33,81■■■■□ 3
Prkab2Q6PAM0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Prkab2Q6PAM0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Prkab2Q6PAM0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Prkab2Q6PAM0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Prkab2Q6PAM0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Prkab2Q6PAM0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Prkab2Q6PAM0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Prkab2Q6PAM0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Prkab2Q6PAM0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Prkab2Q6PAM0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Prkab2Q6PAM0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Prkab2Q6PAM0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Prkab2Q6PAM0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Prkab2Q6PAM0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Prkab2Q6PAM0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Prkab2Q6PAM0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Prkab2Q6PAM0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Prkab2Q6PAM0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Prkab2Q6PAM0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Prkab2Q6PAM0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33,55■■■□□ 2,96
Prkab2Q6PAM0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Prkab2Q6PAM0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Prkab2Q6PAM0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Prkab2Q6PAM0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Prkab2Q6PAM0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Prkab2Q6PAM0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33,49■■■□□ 2,95
Prkab2Q6PAM0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Prkab2Q6PAM0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Prkab2Q6PAM0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Prkab2Q6PAM0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,44■■■□□ 2,94
Prkab2Q6PAM0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Prkab2Q6PAM0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Prkab2Q6PAM0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Prkab2Q6PAM0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Prkab2Q6PAM0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Prkab2Q6PAM0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Prkab2Q6PAM0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Prkab2Q6PAM0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Prkab2Q6PAM0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Prkab2Q6PAM0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Prkab2Q6PAM0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Prkab2Q6PAM0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Prkab2Q6PAM0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Prkab2Q6PAM0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Prkab2Q6PAM0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Prkab2Q6PAM0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Prkab2Q6PAM0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Prkab2Q6PAM0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Prkab2Q6PAM0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Prkab2Q6PAM0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Prkab2Q6PAM0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33,15■■■□□ 2,9
Prkab2Q6PAM0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Prkab2Q6PAM0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Prkab2Q6PAM0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Prkab2Q6PAM0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Prkab2Q6PAM0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Prkab2Q6PAM0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Prkab2Q6PAM0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Prkab2Q6PAM0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Prkab2Q6PAM0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Prkab2Q6PAM0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Prkab2Q6PAM0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Prkab2Q6PAM0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Prkab2Q6PAM0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Prkab2Q6PAM0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Prkab2Q6PAM0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Prkab2Q6PAM0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Prkab2Q6PAM0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32,96■■■□□ 2,87
Prkab2Q6PAM0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Prkab2Q6PAM0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Prkab2Q6PAM0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Prkab2Q6PAM0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Prkab2Q6PAM0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Prkab2Q6PAM0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Prkab2Q6PAM0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Prkab2Q6PAM0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Prkab2Q6PAM0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Prkab2Q6PAM0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Prkab2Q6PAM0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Prkab2Q6PAM0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Prkab2Q6PAM0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Prkab2Q6PAM0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Prkab2Q6PAM0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Prkab2Q6PAM0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Prkab2Q6PAM0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Prkab2Q6PAM0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Prkab2Q6PAM0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Prkab2Q6PAM0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Prkab2Q6PAM0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Prkab2Q6PAM0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Prkab2Q6PAM0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Prkab2Q6PAM0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32,75■■■□□ 2,83
Prkab2Q6PAM0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Prkab2Q6PAM0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,75■■■□□ 2,83
Prkab2Q6PAM0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Prkab2Q6PAM0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Prkab2Q6PAM0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Prkab2Q6PAM0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms