Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Senp6Q6P7W0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Senp6Q6P7W0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Senp6Q6P7W0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Senp6Q6P7W0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Senp6Q6P7W0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Senp6Q6P7W0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Senp6Q6P7W0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Senp6Q6P7W0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Senp6Q6P7W0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Senp6Q6P7W0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Senp6Q6P7W0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Senp6Q6P7W0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Senp6Q6P7W0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Senp6Q6P7W0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Senp6Q6P7W0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Senp6Q6P7W0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Senp6Q6P7W0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Senp6Q6P7W0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Senp6Q6P7W0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Senp6Q6P7W0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Senp6Q6P7W0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Senp6Q6P7W0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Senp6Q6P7W0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Senp6Q6P7W0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Senp6Q6P7W0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Senp6Q6P7W0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Senp6Q6P7W0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Senp6Q6P7W0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Senp6Q6P7W0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Senp6Q6P7W0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Senp6Q6P7W0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Senp6Q6P7W0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Senp6Q6P7W0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Senp6Q6P7W0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Senp6Q6P7W0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Senp6Q6P7W0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Senp6Q6P7W0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Senp6Q6P7W0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Senp6Q6P7W0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Senp6Q6P7W0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Senp6Q6P7W0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Senp6Q6P7W0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Senp6Q6P7W0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Senp6Q6P7W0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Senp6Q6P7W0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Senp6Q6P7W0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Senp6Q6P7W0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Senp6Q6P7W0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Senp6Q6P7W0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Senp6Q6P7W0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Senp6Q6P7W0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Senp6Q6P7W0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Senp6Q6P7W0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Senp6Q6P7W0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Senp6Q6P7W0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Senp6Q6P7W0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Senp6Q6P7W0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Senp6Q6P7W0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Senp6Q6P7W0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Senp6Q6P7W0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Senp6Q6P7W0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Senp6Q6P7W0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Senp6Q6P7W0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Senp6Q6P7W0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Senp6Q6P7W0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Senp6Q6P7W0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Senp6Q6P7W0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Senp6Q6P7W0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Senp6Q6P7W0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Senp6Q6P7W0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Senp6Q6P7W0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Senp6Q6P7W0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Senp6Q6P7W0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Senp6Q6P7W0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Senp6Q6P7W0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Senp6Q6P7W0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Senp6Q6P7W0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Senp6Q6P7W0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Senp6Q6P7W0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Senp6Q6P7W0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Senp6Q6P7W0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Senp6Q6P7W0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Senp6Q6P7W0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Senp6Q6P7W0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Senp6Q6P7W0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Senp6Q6P7W0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Senp6Q6P7W0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms