Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Kdm2bQ6P1G2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Kdm2bQ6P1G2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Kdm2bQ6P1G2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,71■■■■□ 3,31
Kdm2bQ6P1G2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Kdm2bQ6P1G2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Kdm2bQ6P1G2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Kdm2bQ6P1G2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Kdm2bQ6P1G2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Kdm2bQ6P1G2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Kdm2bQ6P1G2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Kdm2bQ6P1G2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Kdm2bQ6P1G2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Kdm2bQ6P1G2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Kdm2bQ6P1G2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,29
Kdm2bQ6P1G2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Kdm2bQ6P1G2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Kdm2bQ6P1G2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Kdm2bQ6P1G2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Kdm2bQ6P1G2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Kdm2bQ6P1G2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Kdm2bQ6P1G2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Kdm2bQ6P1G2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Kdm2bQ6P1G2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Kdm2bQ6P1G2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Kdm2bQ6P1G2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Kdm2bQ6P1G2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Kdm2bQ6P1G2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Kdm2bQ6P1G2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Kdm2bQ6P1G2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Kdm2bQ6P1G2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Kdm2bQ6P1G2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Kdm2bQ6P1G2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Kdm2bQ6P1G2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Kdm2bQ6P1G2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Kdm2bQ6P1G2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Kdm2bQ6P1G2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Kdm2bQ6P1G2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35,27■■■■□ 3,24
Kdm2bQ6P1G2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Kdm2bQ6P1G2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Kdm2bQ6P1G2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Kdm2bQ6P1G2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Kdm2bQ6P1G2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Kdm2bQ6P1G2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35,15■■■■□ 3,22
Kdm2bQ6P1G2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Kdm2bQ6P1G2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Kdm2bQ6P1G2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Kdm2bQ6P1G2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35,12■■■■□ 3,21
Kdm2bQ6P1G2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Kdm2bQ6P1G2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35,11■■■■□ 3,21
Kdm2bQ6P1G2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Kdm2bQ6P1G2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Kdm2bQ6P1G2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Kdm2bQ6P1G2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Kdm2bQ6P1G2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35,05■■■■□ 3,2
Kdm2bQ6P1G2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Kdm2bQ6P1G2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Kdm2bQ6P1G2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35,03■■■■□ 3,2
Kdm2bQ6P1G2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35,02■■■■□ 3,2
Kdm2bQ6P1G2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35,01■■■■□ 3,19
Kdm2bQ6P1G2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Kdm2bQ6P1G2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Kdm2bQ6P1G2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Kdm2bQ6P1G2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Kdm2bQ6P1G2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34,91■■■■□ 3,18
Kdm2bQ6P1G2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Kdm2bQ6P1G2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Kdm2bQ6P1G2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Kdm2bQ6P1G2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Kdm2bQ6P1G2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Kdm2bQ6P1G2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Kdm2bQ6P1G2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Kdm2bQ6P1G2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,76■■■■□ 3,16
Kdm2bQ6P1G2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34,75■■■■□ 3,15
Kdm2bQ6P1G2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Kdm2bQ6P1G2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Kdm2bQ6P1G2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Kdm2bQ6P1G2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Kdm2bQ6P1G2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Kdm2bQ6P1G2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Kdm2bQ6P1G2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34,63■■■■□ 3,13
Kdm2bQ6P1G2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Kdm2bQ6P1G2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Kdm2bQ6P1G2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Kdm2bQ6P1G2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34,57■■■■□ 3,13
Kdm2bQ6P1G2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Kdm2bQ6P1G2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Kdm2bQ6P1G2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Kdm2bQ6P1G2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Kdm2bQ6P1G2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34,54■■■■□ 3,12
Kdm2bQ6P1G2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Kdm2bQ6P1G2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Kdm2bQ6P1G2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34,49■■■■□ 3,11
Kdm2bQ6P1G2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Kdm2bQ6P1G2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Kdm2bQ6P1G2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Kdm2bQ6P1G2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms