Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gpbp1l1Q6NZP2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gpbp1l1Q6NZP2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gpbp1l1Q6NZP2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gpbp1l1Q6NZP2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gpbp1l1Q6NZP2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpbp1l1Q6NZP2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gpbp1l1Q6NZP2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gpbp1l1Q6NZP2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gpbp1l1Q6NZP2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gpbp1l1Q6NZP2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gpbp1l1Q6NZP2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms