Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Soga3Q6NZL0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Soga3Q6NZL0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Soga3Q6NZL0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Soga3Q6NZL0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Soga3Q6NZL0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Soga3Q6NZL0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Soga3Q6NZL0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Soga3Q6NZL0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Soga3Q6NZL0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Soga3Q6NZL0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Soga3Q6NZL0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Soga3Q6NZL0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Soga3Q6NZL0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Soga3Q6NZL0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Soga3Q6NZL0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Soga3Q6NZL0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Soga3Q6NZL0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Soga3Q6NZL0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Soga3Q6NZL0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Soga3Q6NZL0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Soga3Q6NZL0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Soga3Q6NZL0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Soga3Q6NZL0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Soga3Q6NZL0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Soga3Q6NZL0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Soga3Q6NZL0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Soga3Q6NZL0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Soga3Q6NZL0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Soga3Q6NZL0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Soga3Q6NZL0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Soga3Q6NZL0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Soga3Q6NZL0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Soga3Q6NZL0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Soga3Q6NZL0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Soga3Q6NZL0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Soga3Q6NZL0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Soga3Q6NZL0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Soga3Q6NZL0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Soga3Q6NZL0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Soga3Q6NZL0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Soga3Q6NZL0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Soga3Q6NZL0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Soga3Q6NZL0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Soga3Q6NZL0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Soga3Q6NZL0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Soga3Q6NZL0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Soga3Q6NZL0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Soga3Q6NZL0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Soga3Q6NZL0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Soga3Q6NZL0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Soga3Q6NZL0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Soga3Q6NZL0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Soga3Q6NZL0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Soga3Q6NZL0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Soga3Q6NZL0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Soga3Q6NZL0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Soga3Q6NZL0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Soga3Q6NZL0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Soga3Q6NZL0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Soga3Q6NZL0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Soga3Q6NZL0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Soga3Q6NZL0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Soga3Q6NZL0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Soga3Q6NZL0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Soga3Q6NZL0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Soga3Q6NZL0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Soga3Q6NZL0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Soga3Q6NZL0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Soga3Q6NZL0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Soga3Q6NZL0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Soga3Q6NZL0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Soga3Q6NZL0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Soga3Q6NZL0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Soga3Q6NZL0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Soga3Q6NZL0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Soga3Q6NZL0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Soga3Q6NZL0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Soga3Q6NZL0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Soga3Q6NZL0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Soga3Q6NZL0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Soga3Q6NZL0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Soga3Q6NZL0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Soga3Q6NZL0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Soga3Q6NZL0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Soga3Q6NZL0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Soga3Q6NZL0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Soga3Q6NZL0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Soga3Q6NZL0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 370.9 ms