Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Wdr44Q6NVE8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Wdr44Q6NVE8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Wdr44Q6NVE8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Wdr44Q6NVE8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Wdr44Q6NVE8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Wdr44Q6NVE8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Wdr44Q6NVE8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Wdr44Q6NVE8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Wdr44Q6NVE8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Wdr44Q6NVE8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Wdr44Q6NVE8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Wdr44Q6NVE8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Wdr44Q6NVE8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Wdr44Q6NVE8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Wdr44Q6NVE8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Wdr44Q6NVE8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Wdr44Q6NVE8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Wdr44Q6NVE8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Wdr44Q6NVE8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Wdr44Q6NVE8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Wdr44Q6NVE8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Wdr44Q6NVE8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Wdr44Q6NVE8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Wdr44Q6NVE8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Wdr44Q6NVE8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Wdr44Q6NVE8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Wdr44Q6NVE8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Wdr44Q6NVE8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Wdr44Q6NVE8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Wdr44Q6NVE8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Wdr44Q6NVE8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Wdr44Q6NVE8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Wdr44Q6NVE8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Wdr44Q6NVE8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Wdr44Q6NVE8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Wdr44Q6NVE8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Wdr44Q6NVE8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Wdr44Q6NVE8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Wdr44Q6NVE8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Wdr44Q6NVE8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Wdr44Q6NVE8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Wdr44Q6NVE8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Wdr44Q6NVE8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Wdr44Q6NVE8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Wdr44Q6NVE8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Wdr44Q6NVE8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Wdr44Q6NVE8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Wdr44Q6NVE8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Wdr44Q6NVE8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Wdr44Q6NVE8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Wdr44Q6NVE8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Wdr44Q6NVE8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Wdr44Q6NVE8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Wdr44Q6NVE8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Wdr44Q6NVE8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Wdr44Q6NVE8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Wdr44Q6NVE8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Wdr44Q6NVE8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Wdr44Q6NVE8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Wdr44Q6NVE8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Wdr44Q6NVE8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Wdr44Q6NVE8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Wdr44Q6NVE8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Wdr44Q6NVE8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Wdr44Q6NVE8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Wdr44Q6NVE8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Wdr44Q6NVE8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Wdr44Q6NVE8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Wdr44Q6NVE8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Wdr44Q6NVE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Wdr44Q6NVE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Wdr44Q6NVE8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Wdr44Q6NVE8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Wdr44Q6NVE8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Wdr44Q6NVE8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Wdr44Q6NVE8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Wdr44Q6NVE8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Wdr44Q6NVE8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Wdr44Q6NVE8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Wdr44Q6NVE8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Wdr44Q6NVE8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Wdr44Q6NVE8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Wdr44Q6NVE8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Wdr44Q6NVE8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Wdr44Q6NVE8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Wdr44Q6NVE8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Wdr44Q6NVE8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Wdr44Q6NVE8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Wdr44Q6NVE8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Wdr44Q6NVE8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Wdr44Q6NVE8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Wdr44Q6NVE8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Wdr44Q6NVE8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Wdr44Q6NVE8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,64■■■□□ 2,02
Wdr44Q6NVE8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Wdr44Q6NVE8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Wdr44Q6NVE8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Wdr44Q6NVE8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms