Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Fbxo41Q6NS60 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Fbxo41Q6NS60 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Fbxo41Q6NS60 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Fbxo41Q6NS60 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Fbxo41Q6NS60 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Fbxo41Q6NS60 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Fbxo41Q6NS60 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Fbxo41Q6NS60 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Fbxo41Q6NS60 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Fbxo41Q6NS60 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Fbxo41Q6NS60 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Fbxo41Q6NS60 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Fbxo41Q6NS60 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Fbxo41Q6NS60 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Fbxo41Q6NS60 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Fbxo41Q6NS60 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Fbxo41Q6NS60 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Fbxo41Q6NS60 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Fbxo41Q6NS60 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Fbxo41Q6NS60 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Fbxo41Q6NS60 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Fbxo41Q6NS60 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Fbxo41Q6NS60 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Fbxo41Q6NS60 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Fbxo41Q6NS60 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Fbxo41Q6NS60 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Fbxo41Q6NS60 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Fbxo41Q6NS60 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Fbxo41Q6NS60 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Fbxo41Q6NS60 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Fbxo41Q6NS60 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Fbxo41Q6NS60 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Fbxo41Q6NS60 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Fbxo41Q6NS60 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
Fbxo41Q6NS60 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Fbxo41Q6NS60 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Fbxo41Q6NS60 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Fbxo41Q6NS60 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Fbxo41Q6NS60 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Fbxo41Q6NS60 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Fbxo41Q6NS60 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Fbxo41Q6NS60 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Fbxo41Q6NS60 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Fbxo41Q6NS60 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Fbxo41Q6NS60 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Fbxo41Q6NS60 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Fbxo41Q6NS60 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Fbxo41Q6NS60 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Fbxo41Q6NS60 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Fbxo41Q6NS60 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Fbxo41Q6NS60 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Fbxo41Q6NS60 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Fbxo41Q6NS60 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Fbxo41Q6NS60 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Fbxo41Q6NS60 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Fbxo41Q6NS60 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Fbxo41Q6NS60 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Fbxo41Q6NS60 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Fbxo41Q6NS60 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Fbxo41Q6NS60 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Fbxo41Q6NS60 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Fbxo41Q6NS60 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Fbxo41Q6NS60 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Fbxo41Q6NS60 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Fbxo41Q6NS60 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Fbxo41Q6NS60 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Fbxo41Q6NS60 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Fbxo41Q6NS60 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Fbxo41Q6NS60 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fbxo41Q6NS60 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Fbxo41Q6NS60 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Fbxo41Q6NS60 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Fbxo41Q6NS60 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Fbxo41Q6NS60 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Fbxo41Q6NS60 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Fbxo41Q6NS60 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Fbxo41Q6NS60 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Fbxo41Q6NS60 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Fbxo41Q6NS60 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Fbxo41Q6NS60 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Fbxo41Q6NS60 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Fbxo41Q6NS60 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Fbxo41Q6NS60 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Fbxo41Q6NS60 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Fbxo41Q6NS60 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Fbxo41Q6NS60 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Fbxo41Q6NS60 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fbxo41Q6NS60 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Fbxo41Q6NS60 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Fbxo41Q6NS60 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Fbxo41Q6NS60 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Fbxo41Q6NS60 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Fbxo41Q6NS60 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Fbxo41Q6NS60 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Fbxo41Q6NS60 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Fbxo41Q6NS60 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Fbxo41Q6NS60 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Fbxo41Q6NS60 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fbxo41Q6NS60 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms