Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sohlh1Q6IUP1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sohlh1Q6IUP1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sohlh1Q6IUP1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sohlh1Q6IUP1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sohlh1Q6IUP1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sohlh1Q6IUP1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sohlh1Q6IUP1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sohlh1Q6IUP1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sohlh1Q6IUP1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sohlh1Q6IUP1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sohlh1Q6IUP1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sohlh1Q6IUP1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sohlh1Q6IUP1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sohlh1Q6IUP1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sohlh1Q6IUP1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sohlh1Q6IUP1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sohlh1Q6IUP1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sohlh1Q6IUP1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sohlh1Q6IUP1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sohlh1Q6IUP1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sohlh1Q6IUP1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sohlh1Q6IUP1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sohlh1Q6IUP1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sohlh1Q6IUP1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sohlh1Q6IUP1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sohlh1Q6IUP1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sohlh1Q6IUP1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sohlh1Q6IUP1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sohlh1Q6IUP1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sohlh1Q6IUP1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sohlh1Q6IUP1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sohlh1Q6IUP1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sohlh1Q6IUP1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sohlh1Q6IUP1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sohlh1Q6IUP1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sohlh1Q6IUP1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sohlh1Q6IUP1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sohlh1Q6IUP1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sohlh1Q6IUP1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sohlh1Q6IUP1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sohlh1Q6IUP1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sohlh1Q6IUP1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sohlh1Q6IUP1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sohlh1Q6IUP1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sohlh1Q6IUP1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sohlh1Q6IUP1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sohlh1Q6IUP1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sohlh1Q6IUP1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sohlh1Q6IUP1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sohlh1Q6IUP1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sohlh1Q6IUP1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sohlh1Q6IUP1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sohlh1Q6IUP1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sohlh1Q6IUP1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sohlh1Q6IUP1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sohlh1Q6IUP1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sohlh1Q6IUP1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sohlh1Q6IUP1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sohlh1Q6IUP1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sohlh1Q6IUP1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sohlh1Q6IUP1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sohlh1Q6IUP1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sohlh1Q6IUP1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sohlh1Q6IUP1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sohlh1Q6IUP1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sohlh1Q6IUP1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sohlh1Q6IUP1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sohlh1Q6IUP1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sohlh1Q6IUP1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sohlh1Q6IUP1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sohlh1Q6IUP1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sohlh1Q6IUP1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sohlh1Q6IUP1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sohlh1Q6IUP1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sohlh1Q6IUP1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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