Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZT1

Fan1, Fanconi-associated nuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fan1Q69ZT1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Fan1Q69ZT1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Fan1Q69ZT1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Fan1Q69ZT1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Fan1Q69ZT1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Fan1Q69ZT1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Fan1Q69ZT1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Fan1Q69ZT1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Fan1Q69ZT1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Fan1Q69ZT1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Fan1Q69ZT1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Fan1Q69ZT1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Fan1Q69ZT1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Fan1Q69ZT1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Fan1Q69ZT1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Fan1Q69ZT1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Fan1Q69ZT1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Fan1Q69ZT1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Fan1Q69ZT1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Fan1Q69ZT1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Fan1Q69ZT1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Fan1Q69ZT1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fan1Q69ZT1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Fan1Q69ZT1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Fan1Q69ZT1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Fan1Q69ZT1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Fan1Q69ZT1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Fan1Q69ZT1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Fan1Q69ZT1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Fan1Q69ZT1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Fan1Q69ZT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Fan1Q69ZT1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Fan1Q69ZT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Fan1Q69ZT1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fan1Q69ZT1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fan1Q69ZT1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Fan1Q69ZT1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Fan1Q69ZT1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Fan1Q69ZT1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Fan1Q69ZT1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Fan1Q69ZT1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Fan1Q69ZT1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fan1Q69ZT1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Fan1Q69ZT1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Fan1Q69ZT1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Fan1Q69ZT1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Fan1Q69ZT1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Fan1Q69ZT1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Fan1Q69ZT1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Fan1Q69ZT1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Fan1Q69ZT1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Fan1Q69ZT1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Fan1Q69ZT1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Fan1Q69ZT1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Fan1Q69ZT1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Fan1Q69ZT1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Fan1Q69ZT1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Fan1Q69ZT1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Fan1Q69ZT1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Fan1Q69ZT1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Fan1Q69ZT1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Fan1Q69ZT1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Fan1Q69ZT1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Fan1Q69ZT1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Fan1Q69ZT1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fan1Q69ZT1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fan1Q69ZT1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fan1Q69ZT1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Fan1Q69ZT1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Fan1Q69ZT1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fan1Q69ZT1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fan1Q69ZT1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fan1Q69ZT1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fan1Q69ZT1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fan1Q69ZT1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Fan1Q69ZT1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Fan1Q69ZT1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Fan1Q69ZT1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Fan1Q69ZT1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Fan1Q69ZT1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Fan1Q69ZT1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Fan1Q69ZT1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Fan1Q69ZT1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Fan1Q69ZT1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Fan1Q69ZT1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fan1Q69ZT1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fan1Q69ZT1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Fan1Q69ZT1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Fan1Q69ZT1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Fan1Q69ZT1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Fan1Q69ZT1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Fan1Q69ZT1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Fan1Q69ZT1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Fan1Q69ZT1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Fan1Q69ZT1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fan1Q69ZT1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Fan1Q69ZT1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Fan1Q69ZT1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Fan1Q69ZT1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Fan1Q69ZT1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms