Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jmjd1cQ69ZK6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jmjd1cQ69ZK6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jmjd1cQ69ZK6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Jmjd1cQ69ZK6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Jmjd1cQ69ZK6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Jmjd1cQ69ZK6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Jmjd1cQ69ZK6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd1cQ69ZK6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Jmjd1cQ69ZK6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Jmjd1cQ69ZK6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Jmjd1cQ69ZK6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd1cQ69ZK6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jmjd1cQ69ZK6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd1cQ69ZK6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jmjd1cQ69ZK6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd1cQ69ZK6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd1cQ69ZK6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jmjd1cQ69ZK6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jmjd1cQ69ZK6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Jmjd1cQ69ZK6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jmjd1cQ69ZK6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Jmjd1cQ69ZK6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Jmjd1cQ69ZK6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Jmjd1cQ69ZK6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Jmjd1cQ69ZK6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Jmjd1cQ69ZK6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Jmjd1cQ69ZK6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Jmjd1cQ69ZK6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Jmjd1cQ69ZK6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Jmjd1cQ69ZK6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Jmjd1cQ69ZK6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd1cQ69ZK6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd1cQ69ZK6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd1cQ69ZK6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Jmjd1cQ69ZK6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd1cQ69ZK6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd1cQ69ZK6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd1cQ69ZK6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd1cQ69ZK6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd1cQ69ZK6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd1cQ69ZK6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jmjd1cQ69ZK6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd1cQ69ZK6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Jmjd1cQ69ZK6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd1cQ69ZK6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd1cQ69ZK6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jmjd1cQ69ZK6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd1cQ69ZK6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jmjd1cQ69ZK6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd1cQ69ZK6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd1cQ69ZK6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd1cQ69ZK6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd1cQ69ZK6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Jmjd1cQ69ZK6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Jmjd1cQ69ZK6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Jmjd1cQ69ZK6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Jmjd1cQ69ZK6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Jmjd1cQ69ZK6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Jmjd1cQ69ZK6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Jmjd1cQ69ZK6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Jmjd1cQ69ZK6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Jmjd1cQ69ZK6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Jmjd1cQ69ZK6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms