Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Git1Q68FF6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Git1Q68FF6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Git1Q68FF6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Git1Q68FF6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Git1Q68FF6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Git1Q68FF6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Git1Q68FF6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Git1Q68FF6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Git1Q68FF6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Git1Q68FF6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Git1Q68FF6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Git1Q68FF6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Git1Q68FF6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Git1Q68FF6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Git1Q68FF6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Git1Q68FF6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Git1Q68FF6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Git1Q68FF6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Git1Q68FF6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Git1Q68FF6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Git1Q68FF6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Git1Q68FF6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Git1Q68FF6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Git1Q68FF6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Git1Q68FF6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Git1Q68FF6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Git1Q68FF6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Git1Q68FF6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Git1Q68FF6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Git1Q68FF6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Git1Q68FF6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Git1Q68FF6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Git1Q68FF6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Git1Q68FF6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Git1Q68FF6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Git1Q68FF6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Git1Q68FF6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Git1Q68FF6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Git1Q68FF6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Git1Q68FF6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Git1Q68FF6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Git1Q68FF6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Git1Q68FF6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Git1Q68FF6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Git1Q68FF6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Git1Q68FF6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Git1Q68FF6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Git1Q68FF6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Git1Q68FF6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Git1Q68FF6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Git1Q68FF6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Git1Q68FF6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Git1Q68FF6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Git1Q68FF6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Git1Q68FF6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Git1Q68FF6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Git1Q68FF6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Git1Q68FF6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Git1Q68FF6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Git1Q68FF6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Git1Q68FF6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Git1Q68FF6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Git1Q68FF6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Git1Q68FF6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Git1Q68FF6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Git1Q68FF6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Git1Q68FF6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Git1Q68FF6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Git1Q68FF6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Git1Q68FF6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Git1Q68FF6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Git1Q68FF6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Git1Q68FF6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Git1Q68FF6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Git1Q68FF6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Git1Q68FF6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Git1Q68FF6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Git1Q68FF6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Git1Q68FF6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Git1Q68FF6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Git1Q68FF6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Git1Q68FF6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Git1Q68FF6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Git1Q68FF6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Git1Q68FF6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Git1Q68FF6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Git1Q68FF6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Git1Q68FF6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Git1Q68FF6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Git1Q68FF6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Git1Q68FF6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Git1Q68FF6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Git1Q68FF6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Git1Q68FF6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Git1Q68FF6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Git1Q68FF6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Git1Q68FF6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Git1Q68FF6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Git1Q68FF6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms