Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Top2bQ64511 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
Top2bQ64511 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Top2bQ64511 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Top2bQ64511 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Top2bQ64511 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC45.48■■■■■ 4.87
Top2bQ64511 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Top2bQ64511 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
Top2bQ64511 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Top2bQ64511 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
Top2bQ64511 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
Top2bQ64511 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
Top2bQ64511 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Top2bQ64511 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
Top2bQ64511 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Top2bQ64511 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Top2bQ64511 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC45.3■■■■■ 4.84
Top2bQ64511 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Top2bQ64511 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Top2bQ64511 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Top2bQ64511 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Top2bQ64511 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
Top2bQ64511 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.83
Top2bQ64511 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Top2bQ64511 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Top2bQ64511 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Top2bQ64511 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Top2bQ64511 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Top2bQ64511 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Top2bQ64511 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Top2bQ64511 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Top2bQ64511 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
Top2bQ64511 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
Top2bQ64511 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
Top2bQ64511 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Top2bQ64511 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Top2bQ64511 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Top2bQ64511 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
Top2bQ64511 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Top2bQ64511 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Top2bQ64511 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
Top2bQ64511 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
Top2bQ64511 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Top2bQ64511 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Top2bQ64511 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
Top2bQ64511 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
Top2bQ64511 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Top2bQ64511 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Top2bQ64511 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Top2bQ64511 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Top2bQ64511 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Top2bQ64511 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Top2bQ64511 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
Top2bQ64511 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
Top2bQ64511 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Top2bQ64511 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Top2bQ64511 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Top2bQ64511 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Top2bQ64511 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Top2bQ64511 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Top2bQ64511 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Top2bQ64511 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Top2bQ64511 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Top2bQ64511 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
Top2bQ64511 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Top2bQ64511 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Top2bQ64511 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Top2bQ64511 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Top2bQ64511 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Top2bQ64511 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Top2bQ64511 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Top2bQ64511 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Top2bQ64511 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Top2bQ64511 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
Top2bQ64511 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC44.38■■■■■ 4.69
Top2bQ64511 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Top2bQ64511 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
Top2bQ64511 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Top2bQ64511 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Top2bQ64511 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
Top2bQ64511 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Top2bQ64511 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Top2bQ64511 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC44.26■■■■■ 4.68
Top2bQ64511 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Top2bQ64511 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Top2bQ64511 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Top2bQ64511 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Top2bQ64511 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Top2bQ64511 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Top2bQ64511 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Top2bQ64511 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Top2bQ64511 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Top2bQ64511 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
Top2bQ64511 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Top2bQ64511 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
Top2bQ64511 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Top2bQ64511 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
Top2bQ64511 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Top2bQ64511 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Top2bQ64511 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms