Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Vil1Q62468 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Vil1Q62468 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Vil1Q62468 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Vil1Q62468 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Vil1Q62468 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Vil1Q62468 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Vil1Q62468 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Vil1Q62468 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Vil1Q62468 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Vil1Q62468 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Vil1Q62468 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Vil1Q62468 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Vil1Q62468 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Vil1Q62468 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Vil1Q62468 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Vil1Q62468 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Vil1Q62468 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Vil1Q62468 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Vil1Q62468 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Vil1Q62468 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Vil1Q62468 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Vil1Q62468 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Vil1Q62468 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Vil1Q62468 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Vil1Q62468 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Vil1Q62468 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Vil1Q62468 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Vil1Q62468 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Vil1Q62468 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Vil1Q62468 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Vil1Q62468 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Vil1Q62468 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Vil1Q62468 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Vil1Q62468 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Vil1Q62468 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Vil1Q62468 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Vil1Q62468 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Vil1Q62468 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Vil1Q62468 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Vil1Q62468 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Vil1Q62468 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Vil1Q62468 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Vil1Q62468 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Vil1Q62468 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Vil1Q62468 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Vil1Q62468 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Vil1Q62468 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Vil1Q62468 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Vil1Q62468 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Vil1Q62468 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Vil1Q62468 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Vil1Q62468 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Vil1Q62468 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Vil1Q62468 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Vil1Q62468 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Vil1Q62468 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Vil1Q62468 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Vil1Q62468 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Vil1Q62468 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Vil1Q62468 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Vil1Q62468 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Vil1Q62468 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Vil1Q62468 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Vil1Q62468 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Vil1Q62468 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Vil1Q62468 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Vil1Q62468 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Vil1Q62468 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Vil1Q62468 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Vil1Q62468 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Vil1Q62468 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Vil1Q62468 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Vil1Q62468 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Vil1Q62468 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Vil1Q62468 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Vil1Q62468 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Vil1Q62468 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Vil1Q62468 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Vil1Q62468 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Vil1Q62468 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Vil1Q62468 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Vil1Q62468 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Vil1Q62468 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Vil1Q62468 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Vil1Q62468 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Vil1Q62468 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Vil1Q62468 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Vil1Q62468 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Vil1Q62468 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Vil1Q62468 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Vil1Q62468 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Vil1Q62468 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Vil1Q62468 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Vil1Q62468 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Vil1Q62468 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Vil1Q62468 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Vil1Q62468 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Vil1Q62468 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Vil1Q62468 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms