Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Krt33bQ61897 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Krt33bQ61897 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Krt33bQ61897 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Krt33bQ61897 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Krt33bQ61897 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Krt33bQ61897 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Krt33bQ61897 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Krt33bQ61897 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Krt33bQ61897 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Krt33bQ61897 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Krt33bQ61897 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Krt33bQ61897 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
Krt33bQ61897 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21,57■■□□□ 1,04
Krt33bQ61897 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Krt33bQ61897 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Krt33bQ61897 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Krt33bQ61897 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Krt33bQ61897 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Krt33bQ61897 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Krt33bQ61897 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,51■■□□□ 1,03
Krt33bQ61897 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Krt33bQ61897 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Krt33bQ61897 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Krt33bQ61897 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Krt33bQ61897 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Krt33bQ61897 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Krt33bQ61897 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Krt33bQ61897 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Krt33bQ61897 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Krt33bQ61897 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Krt33bQ61897 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Krt33bQ61897 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Krt33bQ61897 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Krt33bQ61897 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Krt33bQ61897 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Krt33bQ61897 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Krt33bQ61897 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,31■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,3■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Krt33bQ61897 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Krt33bQ61897 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21,2■□□□□ 0,98
Krt33bQ61897 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Krt33bQ61897 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Krt33bQ61897 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Krt33bQ61897 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Krt33bQ61897 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Krt33bQ61897 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Krt33bQ61897 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Krt33bQ61897 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,14■□□□□ 0,98
Krt33bQ61897 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Krt33bQ61897 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Krt33bQ61897 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Krt33bQ61897 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21,12■□□□□ 0,97
Krt33bQ61897 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Krt33bQ61897 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Krt33bQ61897 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Krt33bQ61897 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Krt33bQ61897 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Krt33bQ61897 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Krt33bQ61897 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Krt33bQ61897 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Krt33bQ61897 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Krt33bQ61897 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Krt33bQ61897 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms