Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rai1Q61818 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rai1Q61818 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rai1Q61818 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rai1Q61818 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rai1Q61818 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rai1Q61818 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rai1Q61818 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rai1Q61818 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rai1Q61818 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rai1Q61818 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rai1Q61818 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rai1Q61818 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rai1Q61818 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rai1Q61818 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rai1Q61818 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rai1Q61818 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rai1Q61818 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rai1Q61818 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rai1Q61818 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rai1Q61818 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rai1Q61818 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rai1Q61818 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rai1Q61818 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rai1Q61818 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rai1Q61818 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rai1Q61818 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rai1Q61818 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rai1Q61818 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rai1Q61818 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rai1Q61818 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rai1Q61818 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rai1Q61818 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rai1Q61818 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rai1Q61818 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rai1Q61818 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rai1Q61818 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rai1Q61818 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rai1Q61818 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rai1Q61818 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rai1Q61818 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rai1Q61818 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rai1Q61818 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rai1Q61818 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rai1Q61818 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rai1Q61818 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rai1Q61818 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rai1Q61818 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rai1Q61818 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rai1Q61818 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rai1Q61818 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rai1Q61818 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rai1Q61818 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rai1Q61818 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rai1Q61818 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rai1Q61818 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rai1Q61818 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rai1Q61818 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rai1Q61818 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rai1Q61818 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rai1Q61818 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rai1Q61818 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rai1Q61818 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rai1Q61818 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rai1Q61818 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rai1Q61818 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rai1Q61818 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rai1Q61818 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rai1Q61818 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rai1Q61818 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rai1Q61818 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rai1Q61818 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rai1Q61818 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rai1Q61818 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rai1Q61818 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rai1Q61818 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rai1Q61818 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rai1Q61818 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rai1Q61818 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rai1Q61818 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rai1Q61818 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rai1Q61818 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rai1Q61818 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rai1Q61818 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rai1Q61818 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rai1Q61818 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rai1Q61818 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rai1Q61818 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rai1Q61818 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rai1Q61818 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rai1Q61818 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rai1Q61818 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rai1Q61818 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rai1Q61818 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rai1Q61818 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rai1Q61818 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rai1Q61818 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rai1Q61818 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rai1Q61818 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rai1Q61818 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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