Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Itga6Q61739 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Itga6Q61739 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Itga6Q61739 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Itga6Q61739 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Itga6Q61739 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Itga6Q61739 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Itga6Q61739 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Itga6Q61739 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Itga6Q61739 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Itga6Q61739 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Itga6Q61739 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Itga6Q61739 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Itga6Q61739 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Itga6Q61739 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Itga6Q61739 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Itga6Q61739 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Itga6Q61739 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Itga6Q61739 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Itga6Q61739 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Itga6Q61739 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Itga6Q61739 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Itga6Q61739 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Itga6Q61739 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Itga6Q61739 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Itga6Q61739 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Itga6Q61739 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Itga6Q61739 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Itga6Q61739 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Itga6Q61739 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Itga6Q61739 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Itga6Q61739 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Itga6Q61739 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32,26■■■□□ 2,75
Itga6Q61739 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Itga6Q61739 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Itga6Q61739 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Itga6Q61739 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Itga6Q61739 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32,2■■■□□ 2,75
Itga6Q61739 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,2■■■□□ 2,74
Itga6Q61739 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Itga6Q61739 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Itga6Q61739 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Itga6Q61739 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Itga6Q61739 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Itga6Q61739 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,13■■■□□ 2,73
Itga6Q61739 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Itga6Q61739 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Itga6Q61739 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Itga6Q61739 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Itga6Q61739 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32,07■■■□□ 2,72
Itga6Q61739 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Itga6Q61739 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Itga6Q61739 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Itga6Q61739 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Itga6Q61739 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Itga6Q61739 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Itga6Q61739 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Itga6Q61739 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Itga6Q61739 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2,71
Itga6Q61739 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Itga6Q61739 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Itga6Q61739 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Itga6Q61739 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31,95■■■□□ 2,71
Itga6Q61739 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31,93■■■□□ 2,7
Itga6Q61739 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Itga6Q61739 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Itga6Q61739 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Itga6Q61739 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Itga6Q61739 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Itga6Q61739 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Itga6Q61739 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Itga6Q61739 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Itga6Q61739 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31,84■■■□□ 2,69
Itga6Q61739 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Itga6Q61739 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Itga6Q61739 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Itga6Q61739 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Itga6Q61739 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Itga6Q61739 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Itga6Q61739 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Itga6Q61739 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Itga6Q61739 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Itga6Q61739 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Itga6Q61739 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Itga6Q61739 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Itga6Q61739 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,76■■■□□ 2,67
Itga6Q61739 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Itga6Q61739 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Itga6Q61739 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Itga6Q61739 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Itga6Q61739 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Itga6Q61739 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Itga6Q61739 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Itga6Q61739 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Itga6Q61739 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Itga6Q61739 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Itga6Q61739 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Itga6Q61739 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Itga6Q61739 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Itga6Q61739 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms