Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2,39
Astn1Q61137 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Astn1Q61137 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Astn1Q61137 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Astn1Q61137 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Astn1Q61137 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Astn1Q61137 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Astn1Q61137 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Astn1Q61137 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Astn1Q61137 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Astn1Q61137 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Astn1Q61137 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,91■■■□□ 2,38
Astn1Q61137 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Astn1Q61137 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Astn1Q61137 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Astn1Q61137 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Astn1Q61137 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Astn1Q61137 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Astn1Q61137 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Astn1Q61137 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Astn1Q61137 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Astn1Q61137 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Astn1Q61137 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Astn1Q61137 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Astn1Q61137 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Astn1Q61137 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Astn1Q61137 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Astn1Q61137 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,7■■■□□ 2,34
Astn1Q61137 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Astn1Q61137 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Astn1Q61137 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Astn1Q61137 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Astn1Q61137 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Astn1Q61137 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Astn1Q61137 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Astn1Q61137 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Astn1Q61137 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Astn1Q61137 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Astn1Q61137 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Astn1Q61137 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Astn1Q61137 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Astn1Q61137 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Astn1Q61137 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,32
Astn1Q61137 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Astn1Q61137 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Astn1Q61137 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Astn1Q61137 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Astn1Q61137 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Astn1Q61137 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Astn1Q61137 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Astn1Q61137 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Astn1Q61137 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Astn1Q61137 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Astn1Q61137 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Astn1Q61137 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Astn1Q61137 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Astn1Q61137 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Astn1Q61137 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Astn1Q61137 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Astn1Q61137 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Astn1Q61137 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Astn1Q61137 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Astn1Q61137 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Astn1Q61137 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Astn1Q61137 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Astn1Q61137 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Astn1Q61137 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Astn1Q61137 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Astn1Q61137 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Astn1Q61137 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Astn1Q61137 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Astn1Q61137 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Astn1Q61137 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Astn1Q61137 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Astn1Q61137 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Astn1Q61137 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Astn1Q61137 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Astn1Q61137 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Astn1Q61137 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Astn1Q61137 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Astn1Q61137 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Astn1Q61137 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Astn1Q61137 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Astn1Q61137 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Astn1Q61137 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Astn1Q61137 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Astn1Q61137 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Astn1Q61137 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Astn1Q61137 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Astn1Q61137 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Astn1Q61137 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Astn1Q61137 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Astn1Q61137 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Astn1Q61137 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Astn1Q61137 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Astn1Q61137 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Astn1Q61137 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Astn1Q61137 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Astn1Q61137 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Astn1Q61137 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,1 ms