Protein–RNA interactions for Protein: Q61092

Lamc2, Laminin subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc2Q61092 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Lamc2Q61092 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Lamc2Q61092 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Lamc2Q61092 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Lamc2Q61092 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Lamc2Q61092 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,36■■■□□ 2,61
Lamc2Q61092 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Lamc2Q61092 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Lamc2Q61092 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Lamc2Q61092 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,61
Lamc2Q61092 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
Lamc2Q61092 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Lamc2Q61092 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Lamc2Q61092 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Lamc2Q61092 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Lamc2Q61092 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Lamc2Q61092 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Lamc2Q61092 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Lamc2Q61092 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Lamc2Q61092 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Lamc2Q61092 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Lamc2Q61092 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Lamc2Q61092 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31,21■■■□□ 2,59
Lamc2Q61092 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Lamc2Q61092 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Lamc2Q61092 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31,2■■■□□ 2,59
Lamc2Q61092 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Lamc2Q61092 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Lamc2Q61092 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Lamc2Q61092 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Lamc2Q61092 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Lamc2Q61092 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Lamc2Q61092 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Lamc2Q61092 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Lamc2Q61092 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Lamc2Q61092 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Lamc2Q61092 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Lamc2Q61092 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Lamc2Q61092 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Lamc2Q61092 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Lamc2Q61092 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Lamc2Q61092 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Lamc2Q61092 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Lamc2Q61092 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Lamc2Q61092 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Lamc2Q61092 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Lamc2Q61092 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Lamc2Q61092 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,76■■■□□ 2,52
Lamc2Q61092 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Lamc2Q61092 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Lamc2Q61092 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Lamc2Q61092 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Lamc2Q61092 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Lamc2Q61092 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Lamc2Q61092 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Lamc2Q61092 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Lamc2Q61092 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Lamc2Q61092 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Lamc2Q61092 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Lamc2Q61092 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Lamc2Q61092 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Lamc2Q61092 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Lamc2Q61092 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Lamc2Q61092 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Lamc2Q61092 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Lamc2Q61092 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Lamc2Q61092 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Lamc2Q61092 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Lamc2Q61092 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Lamc2Q61092 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Lamc2Q61092 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Lamc2Q61092 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Lamc2Q61092 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Lamc2Q61092 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Lamc2Q61092 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Lamc2Q61092 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Lamc2Q61092 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Lamc2Q61092 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Lamc2Q61092 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Lamc2Q61092 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Lamc2Q61092 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Lamc2Q61092 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Lamc2Q61092 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Lamc2Q61092 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Lamc2Q61092 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Lamc2Q61092 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,2 ms