Protein–RNA interactions for Protein: Q61048

Wbp4, WW domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wbp4Q61048 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Wbp4Q61048 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wbp4Q61048 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Wbp4Q61048 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wbp4Q61048 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wbp4Q61048 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wbp4Q61048 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wbp4Q61048 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wbp4Q61048 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Wbp4Q61048 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Wbp4Q61048 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Wbp4Q61048 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Wbp4Q61048 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Wbp4Q61048 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Wbp4Q61048 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Wbp4Q61048 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Wbp4Q61048 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Wbp4Q61048 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Wbp4Q61048 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wbp4Q61048 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wbp4Q61048 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wbp4Q61048 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Wbp4Q61048 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wbp4Q61048 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wbp4Q61048 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wbp4Q61048 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wbp4Q61048 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wbp4Q61048 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wbp4Q61048 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wbp4Q61048 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wbp4Q61048 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wbp4Q61048 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wbp4Q61048 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wbp4Q61048 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wbp4Q61048 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wbp4Q61048 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms